39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2430 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2430  peptidase M28  100 
 
 
394 aa  806    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611176 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0757  peptidase M28  31.93 
 
 
350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0173595 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0244  aminopeptidase-like protein  29.19 
 
 
386 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1745  peptidase M28  27.59 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1890  hypothetical protein  23.51 
 
 
406 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  30.59 
 
 
563 aa  55.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11798  hypothetical protein  25.71 
 
 
428 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000248048  hitchhiker  0.000230946 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  31.06 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  30.63 
 
 
571 aa  54.3  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  24.84 
 
 
422 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  31.78 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  28.9 
 
 
393 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  28.9 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  33.7 
 
 
512 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  41.43 
 
 
513 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  28.9 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  23.84 
 
 
447 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  23.84 
 
 
447 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  27.47 
 
 
476 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0815  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  32.11 
 
 
357 aa  47  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  32.12 
 
 
547 aa  46.6  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  28.32 
 
 
384 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28420  hypothetical protein  24.04 
 
 
987 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.553187  normal  0.116138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0871  peptidase M28  30.85 
 
 
799 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  30.72 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  38.2 
 
 
764 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  34.29 
 
 
534 aa  43.9  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  29.07 
 
 
481 aa  43.9  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  29.41 
 
 
301 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  28.72 
 
 
500 aa  43.5  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  37.63 
 
 
567 aa  43.9  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  32.85 
 
 
552 aa  43.5  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  31.88 
 
 
555 aa  43.1  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0099  hypothetical protein  26.43 
 
 
435 aa  43.1  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.428389  decreased coverage  0.00133655 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  28.49 
 
 
468 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  27.81 
 
 
468 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  27.81 
 
 
468 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  37.35 
 
 
479 aa  42.7  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  30.12 
 
 
346 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>