More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3473 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  100 
 
 		 432 aa  867    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  82.22 
 
 		 435 aa  729    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  75.18 
 
 		 440 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  70.3 
 
 		 433 aa  622  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  66.13 
 
 		 462 aa  585  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  66.43 
 
 		 440 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  65.51 
 
 		 452 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  65.59 
 
 		 434 aa  566  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  64.17 
 
 		 442 aa  539  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  60.61 
 
 		 429 aa  531  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  61.78 
 
 		 443 aa  525  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  61.27 
 
 		 442 aa  521  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  63.87 
 
 		 442 aa  523  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  62.59 
 
 		 444 aa  523  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  60.8 
 
 		 442 aa  518  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  62.12 
 
 		 438 aa  520  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  59.67 
 
 		 446 aa  509  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  58.1 
 
 		 434 aa  508  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  60.37 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  60.46 
 
 		 445 aa  501  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  60.19 
 
 		 439 aa  492  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  61.81 
 
 		 444 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  59.3 
 
 		 443 aa  488  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  56.34 
 
 		 434 aa  490  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  56 
 
 		 421 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  56.29 
 
 		 448 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  54.52 
 
 		 446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  55.79 
 
 		 449 aa  467  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  55.61 
 
 		 450 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  57.8 
 
 		 444 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  57.8 
 
 		 444 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  57.8 
 
 		 444 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  56.88 
 
 		 451 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  53.46 
 
 		 437 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  56.91 
 
 		 430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  52.69 
 
 		 441 aa  447  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  52.45 
 
 		 439 aa  444  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  52.34 
 
 		 434 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  51.49 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  51.65 
 
 		 468 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  53.88 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  52.61 
 
 		 468 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  31.64 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  31.5 
 
 		 473 aa  170  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  30.49 
 
 		 478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.64 
 
 		 477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  28.7 
 
 		 468 aa  159  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  29.76 
 
 		 469 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  30.32 
 
 		 485 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  33.51 
 
 		 497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  29.8 
 
 		 472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  28.08 
 
 		 467 aa  140  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  28.26 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  30.05 
 
 		 489 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  27.4 
 
 		 508 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  28.61 
 
 		 485 aa  130  6e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  28.35 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  28.05 
 
 		 494 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.68 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  30.13 
 
 		 493 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  27.71 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  29.06 
 
 		 549 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  29.07 
 
 		 493 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  24.76 
 
 		 477 aa  117  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  28.97 
 
 		 493 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  28.89 
 
 		 465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  26.65 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  27.46 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  29.48 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  29.57 
 
 		 510 aa  110  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  29.84 
 
 		 491 aa  109  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  28.21 
 
 		 507 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.13 
 
 		 413 aa  106  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  28.21 
 
 		 507 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  29.35 
 
 		 440 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  25 
 
 		 391 aa  103  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.06 
 
 		 393 aa  103  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  29.38 
 
 		 493 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.44 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  29.56 
 
 		 396 aa  99.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  27.35 
 
 		 415 aa  96.3  9e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  31.58 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  28.53 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  26.23 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.65 
 
 		 404 aa  94.7  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  24.78 
 
 		 407 aa  94.4  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  27.36 
 
 		 380 aa  94  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  26.84 
 
 		 494 aa  93.6  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  34.1 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  25.46 
 
 		 407 aa  90.9  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.29 
 
 		 395 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  24.43 
 
 		 490 aa  90.1  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  31.48 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.62 
 
 		 405 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  24.36 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  25 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  26.88 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  27.23 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.28 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  21.78 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>