More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2199 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  100 
 
 
389 aa  798    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  46.38 
 
 
370 aa  342  5e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  43.24 
 
 
372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  43.24 
 
 
374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  41.89 
 
 
377 aa  299  6e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  42.63 
 
 
372 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  42.05 
 
 
368 aa  287  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  40.17 
 
 
368 aa  283  4.0000000000000003e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2568  peptidase T-like protein  42.05 
 
 
376 aa  280  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00779474  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  41.29 
 
 
372 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  40.71 
 
 
368 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4052  peptidase T  40.75 
 
 
372 aa  276  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3891  peptidase T  40.75 
 
 
372 aa  276  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4278  peptidase, M20/M25/M40 family  40.75 
 
 
372 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0679847  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3898  peptidase T  40.75 
 
 
372 aa  276  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4368  peptidase T  40.75 
 
 
372 aa  276  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4167  peptidase, M20/M25/M40 family  40.75 
 
 
372 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4216  peptidase T  40.75 
 
 
372 aa  275  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00206895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0978  peptidase, M20/M25/M40 family  40.75 
 
 
372 aa  275  9e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4257  peptidase, M20/M25/M40 family  40.75 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  40.48 
 
 
372 aa  271  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  42.74 
 
 
372 aa  271  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3034  peptidase T-like protein  40.7 
 
 
374 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  40.7 
 
 
375 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  39.68 
 
 
377 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  38.61 
 
 
368 aa  264  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  38.46 
 
 
391 aa  260  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  39.62 
 
 
368 aa  260  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  39.84 
 
 
381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  38.52 
 
 
368 aa  249  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  39.84 
 
 
360 aa  249  7e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  38.22 
 
 
383 aa  246  6e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  38.32 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  37.81 
 
 
368 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  38.15 
 
 
365 aa  241  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  36.44 
 
 
374 aa  239  5.999999999999999e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  36.24 
 
 
377 aa  239  8e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  36.24 
 
 
377 aa  239  8e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  37.06 
 
 
375 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  36.89 
 
 
368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0957  peptidase T-like protein  38.75 
 
 
370 aa  224  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000302106  hitchhiker  0.000000131493 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  35.73 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3087  peptidase dimerization domain protein  32.16 
 
 
387 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1507  peptidase M20  29.11 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5236  peptidase M20  32.88 
 
 
403 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3698  putative peptidase  27.46 
 
 
401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.704745  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6480  peptidase T  26.17 
 
 
414 aa  97.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.800823  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  27.37 
 
 
394 aa  89.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1901  peptidase M20  27.07 
 
 
403 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0399  peptidase T  25.72 
 
 
409 aa  87.4  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.168902  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2569  peptidase T  29.41 
 
 
420 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2396  peptidase T  25.82 
 
 
427 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0937974 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08441  peptidase T  24.71 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  26.11 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5117  peptidase T  28.17 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0101  peptidase T  28.62 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0461274  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3250  peptidase T  27.05 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0529  peptidase T  26.06 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00086333  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1922  peptidase T  24.78 
 
 
411 aa  84  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2425  peptidase T  28.12 
 
 
420 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91324  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  25.81 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  30.19 
 
 
372 aa  82.8  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  27.51 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05384  peptidase T  27.02 
 
 
413 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  25.59 
 
 
374 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1652  peptidase T  24.15 
 
 
425 aa  81.6  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0264694  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2667  peptidase M20  25.75 
 
 
461 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00943283  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0953  peptidase T  28.22 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000027828  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1622  peptidase T  24.21 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  27.58 
 
 
409 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2943  peptidase T  26.69 
 
 
407 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1957  peptidase T  26.21 
 
 
409 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.355866  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3800  peptidase T  27.76 
 
 
422 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1306  peptidase T  26.21 
 
 
409 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.841149  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2520  peptidase T  26.21 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00630559  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1328  peptidase T  26.21 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.245439 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2139  peptidase T  25.86 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.359418  normal  0.0575573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2890  peptidase T  27.84 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.223061 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3224  peptidase T  27.02 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.525906  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1344  peptidase T  26.21 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.595235 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  27.81 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5848  peptidase T  25.56 
 
 
410 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362354  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2205  peptidase T  23.99 
 
 
425 aa  77.4  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0029  peptidase T  25.13 
 
 
406 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000506  tripeptide aminopeptidase  27.78 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  24.87 
 
 
409 aa  76.6  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01125  peptidase T  25.86 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  25.86 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  26.34 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  25.86 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  25.86 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0029  peptidase T  25.77 
 
 
406 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  27.2 
 
 
420 aa  76.3  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  25.86 
 
 
422 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  25.86 
 
 
422 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  25.86 
 
 
409 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  27.53 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2574  peptidase T  24.8 
 
 
411 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1595  peptidase T  24.11 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.782792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4565  peptidase T  25.93 
 
 
418 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.36314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>