50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5551 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5551  peptidase M28  100 
 
 		 343 aa  714    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3904  peptidase M28  60.18 
 
 		 344 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.581158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3417  leucine aminopeptidase  50.58 
 
 		 339 aa  324  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0768  hypothetical protein  44.64 
 
 		 335 aa  275  8e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2157  glutamine cyclotransferase-related protein  45.43 
 
 		 333 aa  271  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0856  peptidase M28  45.81 
 
 		 336 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1913  peptidase M28  34.3 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1040  peptidase M28  32.44 
 
 		 320 aa  165  8e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  30.62 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7526  hypothetical protein  31.63 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2681  peptidase M28  28.12 
 
 		 325 aa  90.1  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0134  peptidase M28  26.84 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1835  peptidase M28  25.22 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  29.07 
 
 		 775 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04750  peptidase, M20/M25/M40 family protein  32.64 
 
 		 783 aa  73.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  25.31 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0815  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  28.99 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  28.68 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0871  peptidase M28  29.92 
 
 		 799 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4005  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  27.93 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0935  peptidase M28  27.93 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02603  aminopeptidase in alkaline phosphatase isozyme conversion  27.93 
 
 		 345 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02568  hypothetical protein  27.93 
 
 		 345 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3121  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  27.93 
 
 		 345 aa  53.5  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2891  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  27.93 
 
 		 345 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3054  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  27.93 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.957011  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0959  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  27.93 
 
 		 345 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2879  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  27.93 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01706  glutaminyl cyclase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08280)  22.65 
 
 		 461 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.592246 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  27.57 
 
 		 1103 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  23.91 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3061  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  28.45 
 
 		 348 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3142  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  28.45 
 
 		 348 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.634375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3126  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  28.45 
 
 		 348 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  30.53 
 
 		 318 aa  49.7  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3087  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  28.45 
 
 		 348 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3246  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  28.45 
 
 		 348 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  25.95 
 
 		 407 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3224  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  25.62 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  27.7 
 
 		 555 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  32.48 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  30 
 
 		 273 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  30.43 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  28.89 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  29.23 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3936  peptidase M28  28.81 
 
 		 616 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  29.23 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  28.57 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  22.39 
 
 		 674 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  27.03 
 
 		 440 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>