44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7526 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7526  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3417  leucine aminopeptidase  29.36 
 
 
339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  34.64 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3904  peptidase M28  31.01 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.581158  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1913  peptidase M28  32.97 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5551  peptidase M28  31.29 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0768  hypothetical protein  31.12 
 
 
335 aa  109  6e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2157  glutamine cyclotransferase-related protein  27.18 
 
 
333 aa  107  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0856  peptidase M28  29.47 
 
 
336 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0134  peptidase M28  26.69 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1040  peptidase M28  25.08 
 
 
320 aa  90.9  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2681  peptidase M28  26.09 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1835  peptidase M28  24.83 
 
 
315 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  28.87 
 
 
1103 aa  59.3  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  27.09 
 
 
775 aa  55.8  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  30.96 
 
 
391 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  26.4 
 
 
308 aa  52.8  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  25 
 
 
794 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  24.36 
 
 
584 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1107  peptidase M28  27.23 
 
 
576 aa  50.8  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04750  peptidase, M20/M25/M40 family protein  30.43 
 
 
783 aa  50.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02870  conserved hypothetical protein  31.17 
 
 
402 aa  49.3  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  33.94 
 
 
512 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0871  peptidase M28  26.04 
 
 
799 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  28.51 
 
 
457 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  26.99 
 
 
335 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  30.71 
 
 
466 aa  46.6  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  27.24 
 
 
457 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3936  peptidase M28  25.6 
 
 
616 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  29.45 
 
 
338 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  26.12 
 
 
466 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  35 
 
 
466 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  35 
 
 
466 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3053  peptidase M28  29.92 
 
 
325 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.387481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3011  peptidase M28  29.92 
 
 
325 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844179  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  35 
 
 
466 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  31.91 
 
 
598 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  35 
 
 
466 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  35 
 
 
466 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  35 
 
 
466 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  35 
 
 
466 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  35 
 
 
466 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  28.8 
 
 
625 aa  42.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  33.75 
 
 
465 aa  42.7  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>