128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2824 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2824  peptidase M28  100 
 
 		 771 aa  1484    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264014  normal  0.0144765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  39.92 
 
 		 794 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5347  peptidase M28  38.04 
 
 		 772 aa  350  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0871  peptidase M28  28.4 
 
 		 799 aa  262  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04750  peptidase, M20/M25/M40 family protein  29.64 
 
 		 783 aa  253  6e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  43.15 
 
 		 815 aa  223  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2998  peptidase M28  42.31 
 
 		 778 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17180  predicted aminopeptidase  39.58 
 
 		 747 aa  151  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00826733  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46351  predicted protein  29.23 
 
 		 937 aa  104  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0158707 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10522  Peptidase family M28 family (AFU_orthologue; AFUA_1G05960)  31 
 
 		 953 aa  89  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264533  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  26.2 
 
 		 775 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  35.14 
 
 		 319 aa  73.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  31.06 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  28.68 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  33.59 
 
 		 550 aa  61.6  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  32.97 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00550  expressed protein  25.23 
 
 		 898 aa  59.3  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.187013  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  32.19 
 
 		 550 aa  59.7  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  29.93 
 
 		 339 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  31.78 
 
 		 506 aa  58.9  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  37.36 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  31.74 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  26.85 
 
 		 579 aa  57.4  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  32.37 
 
 		 325 aa  57  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18580  predicted protein  28.5 
 
 		 877 aa  57  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000566018  normal  0.0108768 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0134  peptidase M28  25.97 
 
 		 314 aa  57  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  39.36 
 
 		 549 aa  57.4  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  34.62 
 
 		 512 aa  56.6  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  26.51 
 
 		 571 aa  56.2  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  31.2 
 
 		 514 aa  55.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  32.14 
 
 		 552 aa  55.8  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  32.14 
 
 		 552 aa  55.8  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  27 
 
 		 373 aa  55.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  29.57 
 
 		 342 aa  55.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  31.85 
 
 		 500 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  35.51 
 
 		 575 aa  55.5  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  31.84 
 
 		 625 aa  55.1  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  32.06 
 
 		 559 aa  54.7  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  29.63 
 
 		 678 aa  55.1  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  26.14 
 
 		 334 aa  53.5  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  31.21 
 
 		 488 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  30.73 
 
 		 450 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  29.94 
 
 		 394 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  33.33 
 
 		 502 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  33.33 
 
 		 552 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  29.06 
 
 		 549 aa  52.8  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  27.45 
 
 		 318 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  23.65 
 
 		 529 aa  51.6  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  26.18 
 
 		 346 aa  51.6  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  39.74 
 
 		 510 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  39.74 
 
 		 347 aa  51.6  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  35.71 
 
 		 548 aa  51.2  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  31.72 
 
 		 574 aa  51.2  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  36.36 
 
 		 533 aa  51.2  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  33.98 
 
 		 501 aa  50.8  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  33.98 
 
 		 501 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  33.98 
 
 		 501 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  32.09 
 
 		 424 aa  50.8  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  26.79 
 
 		 346 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  31.97 
 
 		 557 aa  50.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  30.17 
 
 		 422 aa  50.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  32.28 
 
 		 539 aa  49.7  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  30.68 
 
 		 447 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  30.68 
 
 		 447 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  31.97 
 
 		 558 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  28.84 
 
 		 398 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  27.22 
 
 		 546 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  26.43 
 
 		 346 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  25.37 
 
 		 1077 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  31.62 
 
 		 603 aa  49.3  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  27.54 
 
 		 506 aa  49.3  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  39.24 
 
 		 503 aa  48.5  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  25.76 
 
 		 347 aa  48.9  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  31.97 
 
 		 558 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  28.57 
 
 		 312 aa  48.5  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  24.9 
 
 		 386 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  31.97 
 
 		 558 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  38.1 
 
 		 512 aa  48.1  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  31.97 
 
 		 558 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0554  aminopeptidase Y  34.09 
 
 		 479 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0566  aminopeptidase Y  34.09 
 
 		 479 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0544  aminopeptidase Y  34.09 
 
 		 479 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.282981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  28.46 
 
 		 375 aa  48.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0757  peptidase M28  28.43 
 
 		 350 aa  48.1  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0173595 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  25.16 
 
 		 563 aa  47.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  30.71 
 
 		 384 aa  47.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  27.09 
 
 		 352 aa  47.8  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  27.71 
 
 		 309 aa  47.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  33.03 
 
 		 481 aa  47.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  27.78 
 
 		 512 aa  47.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  24.22 
 
 		 1247 aa  47.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  34.62 
 
 		 534 aa  47.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2640  hypothetical protein  30.86 
 
 		 305 aa  46.6  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00540836  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  27.22 
 
 		 552 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  29.51 
 
 		 557 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  26.63 
 
 		 548 aa  46.6  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  30.56 
 
 		 393 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  25.53 
 
 		 465 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0957  peptidase T-like protein  30.4 
 
 		 370 aa  46.2  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000302106  hitchhiker  0.000000131493 
 
 
-
 
NC_002950  PG2157  glutamine cyclotransferase-related protein  28.18 
 
 		 333 aa  45.8  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>