53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_46351 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_46351  predicted protein  100 
 
 		 937 aa  1892    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0158707 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10522  Peptidase family M28 family (AFU_orthologue; AFUA_1G05960)  30.72 
 
 		 953 aa  199  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264533  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0871  peptidase M28  25.33 
 
 		 799 aa  104  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2824  peptidase M28  29.23 
 
 		 771 aa  103  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264014  normal  0.0144765 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04750  peptidase, M20/M25/M40 family protein  25.91 
 
 		 783 aa  98.2  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  28.71 
 
 		 794 aa  97.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3936  peptidase M28  29.78 
 
 		 616 aa  90.1  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  27.78 
 
 		 815 aa  87.4  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5347  peptidase M28  26.16 
 
 		 772 aa  79  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18580  predicted protein  30.8 
 
 		 877 aa  70.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000566018  normal  0.0108768 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00550  expressed protein  29.31 
 
 		 898 aa  68.9  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.187013  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17180  predicted aminopeptidase  27.56 
 
 		 747 aa  63.9  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00826733  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  27.01 
 
 		 678 aa  55.1  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2998  peptidase M28  29.02 
 
 		 778 aa  53.5  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  33.62 
 
 		 544 aa  52  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  27.14 
 
 		 506 aa  51.6  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  26.43 
 
 		 541 aa  51.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  34.15 
 
 		 339 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  34.48 
 
 		 309 aa  50.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  30.12 
 
 		 282 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  28.83 
 
 		 468 aa  50.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  26.43 
 
 		 541 aa  50.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  26.43 
 
 		 541 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  34.57 
 
 		 333 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  24.2 
 
 		 481 aa  49.7  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  34.94 
 
 		 526 aa  49.7  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  26.05 
 
 		 394 aa  49.7  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  36.61 
 
 		 442 aa  48.5  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  26.43 
 
 		 532 aa  48.5  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  25 
 
 		 512 aa  47  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  25.4 
 
 		 424 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  32.53 
 
 		 472 aa  47.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  32.29 
 
 		 313 aa  47  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  37.25 
 
 		 434 aa  47  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  23.85 
 
 		 481 aa  47  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  25 
 
 		 466 aa  47  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  27.14 
 
 		 529 aa  46.6  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  27.34 
 
 		 529 aa  46.6  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  28.42 
 
 		 559 aa  45.8  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  32.53 
 
 		 1077 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  27.08 
 
 		 469 aa  46.2  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  25 
 
 		 540 aa  45.8  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  24 
 
 		 319 aa  45.8  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  33.33 
 
 		 468 aa  45.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3010  allantoate amidohydrolase  39.19 
 
 		 429 aa  45.4  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.140541 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  28.74 
 
 		 539 aa  45.4  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  32.98 
 
 		 546 aa  45.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  31.25 
 
 		 457 aa  45.1  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  26.13 
 
 		 468 aa  45.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  26.13 
 
 		 468 aa  45.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  27.81 
 
 		 334 aa  44.7  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  27.5 
 
 		 525 aa  44.7  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  28.17 
 
 		 518 aa  44.3  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>