More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3211 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  100 
 
 
468 aa  920    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  55.68 
 
 
434 aa  450  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  51.14 
 
 
421 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  52.15 
 
 
432 aa  414  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  50.43 
 
 
452 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  50.45 
 
 
440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  52.91 
 
 
435 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  50.22 
 
 
433 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  52.14 
 
 
440 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  49.21 
 
 
442 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  49.33 
 
 
442 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  50.22 
 
 
462 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  49.77 
 
 
468 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  53.51 
 
 
428 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  50.11 
 
 
442 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  47.43 
 
 
446 aa  376  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  46.71 
 
 
434 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  46.62 
 
 
443 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  48.67 
 
 
442 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  46.49 
 
 
434 aa  375  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  48.52 
 
 
429 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  47.32 
 
 
439 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  47.89 
 
 
443 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  47.06 
 
 
437 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  45.35 
 
 
439 aa  368  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  46.95 
 
 
438 aa  363  3e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  47.06 
 
 
441 aa  363  5.0000000000000005e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  45.19 
 
 
434 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  47.75 
 
 
445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  47.05 
 
 
444 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  45.23 
 
 
451 aa  348  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  46.62 
 
 
444 aa  346  4e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  45.43 
 
 
441 aa  341  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  43.72 
 
 
444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  43.72 
 
 
444 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  43.72 
 
 
444 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  42.18 
 
 
449 aa  327  3e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  41.52 
 
 
448 aa  322  9.000000000000001e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  43.3 
 
 
450 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  40.45 
 
 
446 aa  320  3e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  43.12 
 
 
451 aa  317  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  42.86 
 
 
430 aa  315  8e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  33.62 
 
 
434 aa  179  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  31.59 
 
 
473 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  28.99 
 
 
469 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  29.95 
 
 
478 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  29.2 
 
 
468 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  33.16 
 
 
489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  32.67 
 
 
497 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  30.58 
 
 
493 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  32.07 
 
 
477 aa  136  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  25.38 
 
 
477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  28.82 
 
 
467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  28.46 
 
 
508 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  30.67 
 
 
493 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  28.9 
 
 
487 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  29.68 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  29.35 
 
 
493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  29.68 
 
 
493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  27.87 
 
 
485 aa  129  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  28.77 
 
 
457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  28.24 
 
 
476 aa  126  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  29.1 
 
 
491 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  29.87 
 
 
507 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  29.87 
 
 
507 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  27 
 
 
485 aa  119  9e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  30.81 
 
 
510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  29.46 
 
 
494 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  26.11 
 
 
465 aa  114  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  29.02 
 
 
440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  28.17 
 
 
549 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  28.5 
 
 
374 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.64 
 
 
433 aa  107  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  25.19 
 
 
490 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  26.93 
 
 
419 aa  97.1  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.38 
 
 
395 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.35 
 
 
388 aa  90.1  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.59 
 
 
413 aa  90.1  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  26.17 
 
 
390 aa  88.6  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02910  Gly-X carboxypeptidase, putative  23.04 
 
 
573 aa  89  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.37 
 
 
411 aa  88.2  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04810  vacuolar carboxypeptidase Cps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07040)  26.51 
 
 
581 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0953418  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  25.18 
 
 
494 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  23.74 
 
 
591 aa  84  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  27.24 
 
 
395 aa  82  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  30.59 
 
 
380 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.98 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  26.29 
 
 
421 aa  82.4  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04480  carboxypeptidase s precursor, putative  27.15 
 
 
587 aa  80.5  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0506615  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  27.75 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  22.47 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10986  conserved hypothetical protein  23.81 
 
 
564 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000148304  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  26.75 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  26.55 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  25.3 
 
 
415 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  26.28 
 
 
406 aa  79  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  24.1 
 
 
407 aa  79  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  30.46 
 
 
415 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  25.1 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  27.73 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>