More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2159 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  92.08 
 
 		 442 aa  830    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  896    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  70.68 
 
 		 443 aa  629  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  65.45 
 
 		 442 aa  580  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  65.13 
 
 		 452 aa  567  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  63.95 
 
 		 439 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  65.03 
 
 		 462 aa  558  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  64 
 
 		 433 aa  554  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  63.43 
 
 		 443 aa  557  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  64.34 
 
 		 435 aa  551  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  63.43 
 
 		 440 aa  545  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  61.18 
 
 		 440 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  60.8 
 
 		 432 aa  518  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  60 
 
 		 451 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  57.27 
 
 		 450 aa  511  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  59.13 
 
 		 444 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  59.13 
 
 		 444 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  59.13 
 
 		 444 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  59.12 
 
 		 434 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  56.35 
 
 		 446 aa  502  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  59.67 
 
 		 430 aa  504  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  55.94 
 
 		 448 aa  499  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  55.29 
 
 		 449 aa  497  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  59.32 
 
 		 442 aa  496  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  55.81 
 
 		 434 aa  498  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  57.57 
 
 		 441 aa  494  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  57.97 
 
 		 438 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  54.88 
 
 		 434 aa  489  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  57.08 
 
 		 444 aa  486  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  57.77 
 
 		 446 aa  486  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  57.49 
 
 		 445 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  54.73 
 
 		 441 aa  476  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  57.01 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  53.88 
 
 		 439 aa  465  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  57.57 
 
 		 444 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  52.41 
 
 		 437 aa  449  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  55.16 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  53.36 
 
 		 434 aa  433  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  47.5 
 
 		 451 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  48.59 
 
 		 421 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  49.21 
 
 		 468 aa  385  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  47.75 
 
 		 468 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  32.62 
 
 		 434 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  31.07 
 
 		 478 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  31.68 
 
 		 469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  31.31 
 
 		 485 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.79 
 
 		 477 aa  172  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  30.35 
 
 		 473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  30.25 
 
 		 494 aa  156  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  32.14 
 
 		 489 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  31.38 
 
 		 497 aa  151  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  29.61 
 
 		 472 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  27.99 
 
 		 476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  26.39 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  29.93 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  27.75 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  29.47 
 
 		 465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  28.02 
 
 		 485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  29.95 
 
 		 493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  29.89 
 
 		 493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  26.62 
 
 		 508 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  30.51 
 
 		 493 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.88 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  28.87 
 
 		 491 aa  124  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  28.83 
 
 		 549 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  27.93 
 
 		 390 aa  119  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  26.67 
 
 		 507 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  26.67 
 
 		 507 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  24.46 
 
 		 477 aa  116  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  26.09 
 
 		 487 aa  117  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  28.75 
 
 		 510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.47 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  29.64 
 
 		 493 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  32.45 
 
 		 373 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.94 
 
 		 393 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  27.15 
 
 		 421 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.91 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  29.24 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.2 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  25.38 
 
 		 440 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  29.74 
 
 		 397 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  26.05 
 
 		 395 aa  103  7e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  29.34 
 
 		 397 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  27.89 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  28.83 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  27.4 
 
 		 406 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  27.4 
 
 		 406 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.25 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  27.4 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  27.18 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  27.53 
 
 		 428 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  29.36 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  25.25 
 
 		 374 aa  98.6  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2796  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.13 
 
 		 397 aa  96.7  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.884075 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  28.22 
 
 		 397 aa  96.7  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  27.63 
 
 		 406 aa  96.3  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  28 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  26.26 
 
 		 494 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  26.39 
 
 		 404 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  29.69 
 
 		 374 aa  94.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>