244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1065 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  100 
 
 		 455 aa  918    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6133  peptidase M28  49.2 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  46.71 
 
 		 526 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1679  peptidase M28  46.24 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03479  probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  47.39 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1646  peptidase M28  46.53 
 
 		 456 aa  357  2.9999999999999997e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.645217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3859  peptidase M28  45.79 
 
 		 478 aa  350  4e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1875  peptidase M28  46.1 
 
 		 509 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10643  Probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  41.56 
 
 		 450 aa  341  2e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3608  peptidase M28  45.13 
 
 		 472 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1949  peptidase M28  42.24 
 
 		 439 aa  295  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  32.39 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  32.39 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  32.39 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  32.39 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  28.62 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  31.92 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  32.39 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  30 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  26.64 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  29.39 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  27.87 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  25.71 
 
 		 568 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  28 
 
 		 775 aa  74.3  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  31.31 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  25.53 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  29.5 
 
 		 450 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  25.53 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  25.53 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  26.24 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  32 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  26.24 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  28.64 
 
 		 501 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  26.03 
 
 		 591 aa  70.1  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  30.37 
 
 		 677 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07035  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04210)  25.34 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  31.75 
 
 		 523 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28372  leucyl aminopeptidase precursor  24.41 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.36652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  34.72 
 
 		 598 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  29.02 
 
 		 504 aa  66.6  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  34.78 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  34.31 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  23.08 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  33.91 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  28.37 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  27.8 
 
 		 625 aa  63.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  31.78 
 
 		 483 aa  63.2  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  48.65 
 
 		 584 aa  63.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  25.82 
 
 		 347 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  33.04 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  33.04 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  25.51 
 
 		 1103 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  34.21 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  33.04 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  33.04 
 
 		 466 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  33.1 
 
 		 541 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  32.17 
 
 		 465 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  38.14 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  32.17 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  33.04 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  33.04 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  33.1 
 
 		 541 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  38.14 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04080  peptidase, putative  29.32 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.321428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  32.17 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  38.14 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  40.22 
 
 		 557 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  40.22 
 
 		 557 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  31.34 
 
 		 549 aa  60.1  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  40.22 
 
 		 557 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  27.56 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  28.5 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  29.61 
 
 		 944 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  26.44 
 
 		 579 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  45.78 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  37.62 
 
 		 531 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  41.3 
 
 		 556 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  40.96 
 
 		 815 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  38.38 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  32.71 
 
 		 548 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  28.28 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  41.24 
 
 		 550 aa  58.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  33.33 
 
 		 541 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  35.35 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  39.13 
 
 		 558 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  39.13 
 
 		 558 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  24.68 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  36.96 
 
 		 552 aa  57.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  35.54 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  41.49 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  32.46 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  39.13 
 
 		 558 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  40.43 
 
 		 575 aa  57.8  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  37.5 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  27.41 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  39.18 
 
 		 548 aa  56.6  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  27.94 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  26.42 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  39.13 
 
 		 558 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  33.88 
 
 		 540 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>