18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_80203 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_80203  vacuolar targeting protein  100 
 
 		 896 aa  1833    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.397004  normal  0.0921162 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33956  membrane protein involved in vacuolar protein sorting  24.14 
 
 		 800 aa  167  5.9999999999999996e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04018  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03740)  24.27 
 
 		 772 aa  145  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.791672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  26.32 
 
 		 725 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04925  glutamate carboxypeptidase Tre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10650)  24.26 
 
 		 884 aa  108  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0450501  normal  0.0918847 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02920  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  29.47 
 
 		 911 aa  103  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72031  glutamated carboxypeptidase  22.62 
 
 		 847 aa  99.4  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.585457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  24.28 
 
 		 743 aa  92  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  24.37 
 
 		 734 aa  89  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  25.7 
 
 		 678 aa  84.7  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2823  glutamate carboxypeptidase II  26.03 
 
 		 712 aa  84.3  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.261678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2092  Glutamate carboxypeptidase II  22.59 
 
 		 727 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  24.48 
 
 		 757 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  27.72 
 
 		 751 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  27.46 
 
 		 487 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  32.32 
 
 		 525 aa  47.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  24.21 
 
 		 545 aa  47  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  27.89 
 
 		 539 aa  46.2  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>