132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2823 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2823  glutamate carboxypeptidase II  100 
 
 
712 aa  1462    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.261678  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  38.59 
 
 
757 aa  487  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  37.36 
 
 
725 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2092  Glutamate carboxypeptidase II  39.52 
 
 
727 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  38.41 
 
 
743 aa  465  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  36.97 
 
 
678 aa  433  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  36.21 
 
 
751 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  36.17 
 
 
734 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04925  glutamate carboxypeptidase Tre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10650)  30.9 
 
 
884 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0450501  normal  0.0918847 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04018  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03740)  32.45 
 
 
772 aa  294  3e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.791672 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33956  membrane protein involved in vacuolar protein sorting  35.55 
 
 
800 aa  292  1e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02920  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  32.1 
 
 
911 aa  256  9e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72031  glutamated carboxypeptidase  25.05 
 
 
847 aa  146  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.585457 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80203  vacuolar targeting protein  26.29 
 
 
896 aa  84.7  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.397004  normal  0.0921162 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  24.71 
 
 
497 aa  71.2  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  27.85 
 
 
598 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  38.13 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  25.82 
 
 
549 aa  67  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  37.84 
 
 
525 aa  66.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  34.02 
 
 
495 aa  65.1  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  40.4 
 
 
552 aa  61.2  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  34.55 
 
 
526 aa  61.2  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  32.26 
 
 
550 aa  59.3  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  35.09 
 
 
501 aa  59.7  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  24.02 
 
 
487 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  29.7 
 
 
559 aa  59.3  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  35.58 
 
 
454 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  24.19 
 
 
556 aa  58.9  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  36.89 
 
 
533 aa  58.2  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  29.66 
 
 
512 aa  57.8  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  28.86 
 
 
544 aa  57.4  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  29.23 
 
 
528 aa  57  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  26.1 
 
 
563 aa  57  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  26.83 
 
 
531 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  24.43 
 
 
558 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  24.43 
 
 
558 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  33.33 
 
 
481 aa  55.8  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  32 
 
 
552 aa  55.5  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  32 
 
 
552 aa  55.8  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  25.12 
 
 
575 aa  55.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  34.26 
 
 
473 aa  55.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  35.23 
 
 
525 aa  55.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  29.51 
 
 
481 aa  55.1  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  26.85 
 
 
536 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  28.29 
 
 
546 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  26.85 
 
 
535 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  24.1 
 
 
558 aa  54.7  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  24.1 
 
 
522 aa  54.3  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  36.63 
 
 
677 aa  54.3  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  36.67 
 
 
523 aa  53.9  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  24.1 
 
 
557 aa  53.9  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  35.24 
 
 
539 aa  53.9  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  28.57 
 
 
472 aa  53.5  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  33.71 
 
 
468 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  33.71 
 
 
468 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  22.78 
 
 
557 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  31.58 
 
 
467 aa  53.5  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  32.69 
 
 
468 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  32.32 
 
 
477 aa  53.9  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  29.81 
 
 
549 aa  53.9  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  23.47 
 
 
557 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  33.71 
 
 
468 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  23.78 
 
 
558 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  24.08 
 
 
539 aa  52.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  35.29 
 
 
341 aa  52  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  33.61 
 
 
471 aa  52.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  31.94 
 
 
555 aa  52  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  26.28 
 
 
545 aa  51.6  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  34.48 
 
 
417 aa  51.2  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  29.82 
 
 
1103 aa  51.2  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  34.86 
 
 
417 aa  51.2  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  34.86 
 
 
417 aa  51.2  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  23.15 
 
 
557 aa  50.8  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  31.73 
 
 
468 aa  50.8  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  30.46 
 
 
947 aa  50.8  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  34.86 
 
 
417 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  24.25 
 
 
550 aa  50.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  33.94 
 
 
417 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  22.42 
 
 
458 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  31.54 
 
 
469 aa  49.7  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  27.53 
 
 
512 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  26.15 
 
 
547 aa  49.3  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  33.71 
 
 
471 aa  49.3  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  24.33 
 
 
553 aa  49.7  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  32.58 
 
 
469 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  30.3 
 
 
466 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  30.56 
 
 
550 aa  49.7  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  33.03 
 
 
417 aa  49.3  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  26.15 
 
 
529 aa  49.3  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  33.01 
 
 
460 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  30.61 
 
 
468 aa  48.9  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  25.29 
 
 
548 aa  48.9  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  27.15 
 
 
468 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  23.28 
 
 
569 aa  49.3  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  34.38 
 
 
504 aa  48.5  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  29.55 
 
 
468 aa  48.5  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  27.03 
 
 
434 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  37.11 
 
 
408 aa  48.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  22.19 
 
 
529 aa  48.1  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  31.58 
 
 
472 aa  48.1  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>