More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0364 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  100 
 
 
388 aa  781    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  66.4 
 
 
386 aa  507  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  62.05 
 
 
389 aa  463  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  57.67 
 
 
387 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  55.53 
 
 
395 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  54.72 
 
 
387 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  55.15 
 
 
380 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  55 
 
 
382 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  55.03 
 
 
382 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  54.76 
 
 
380 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  55.64 
 
 
384 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  53.97 
 
 
380 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  56.41 
 
 
388 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  54.23 
 
 
380 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  51.85 
 
 
391 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  55.64 
 
 
385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  54.86 
 
 
383 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  53.03 
 
 
388 aa  388  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  47.62 
 
 
383 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  48.95 
 
 
383 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  48.95 
 
 
383 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  48.95 
 
 
383 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  48.95 
 
 
383 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  48.95 
 
 
383 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  49.48 
 
 
383 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  48.95 
 
 
383 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  48.69 
 
 
383 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  49.21 
 
 
383 aa  368  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  48.95 
 
 
383 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  48.69 
 
 
383 aa  364  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  46.83 
 
 
386 aa  361  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  48.28 
 
 
381 aa  357  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  46.86 
 
 
383 aa  355  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  46.86 
 
 
383 aa  355  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  46.86 
 
 
383 aa  355  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  46.86 
 
 
383 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  47.12 
 
 
383 aa  354  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  46.6 
 
 
383 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  46.98 
 
 
382 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  44.44 
 
 
383 aa  351  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  47.03 
 
 
389 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  47.38 
 
 
387 aa  346  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  47.38 
 
 
387 aa  346  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  43.92 
 
 
383 aa  345  6e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  47.38 
 
 
383 aa  341  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0194  acetylornithine deacetylase  46.86 
 
 
382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  43.5 
 
 
381 aa  339  5e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4277  acetylornithine deacetylase  45.77 
 
 
383 aa  336  5e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00886468  normal  0.333205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  45.74 
 
 
383 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  44.21 
 
 
382 aa  325  7e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  43.86 
 
 
378 aa  320  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  43.34 
 
 
378 aa  315  8e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2755  acetylornithine deacetylase  45.07 
 
 
378 aa  299  5e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2221  acetylornithine deacetylase  44.88 
 
 
378 aa  296  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0456385  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1225  peptidase dimerization domain protein  47.2 
 
 
261 aa  236  4e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  37.85 
 
 
386 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  37.85 
 
 
391 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  34.73 
 
 
376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  38.25 
 
 
386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  35.32 
 
 
374 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  36.72 
 
 
387 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  39.16 
 
 
386 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  38.44 
 
 
389 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  35.07 
 
 
382 aa  189  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  36.94 
 
 
375 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  31.52 
 
 
390 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  38.18 
 
 
388 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  35.99 
 
 
387 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  35.76 
 
 
374 aa  186  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  37.2 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  36.57 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  35.29 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  34.83 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  35.54 
 
 
384 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  34.91 
 
 
389 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.19 
 
 
398 aa  183  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  36.05 
 
 
376 aa  182  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  34.32 
 
 
386 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  35.19 
 
 
406 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  36.29 
 
 
390 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  38.82 
 
 
387 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  35.28 
 
 
384 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0717  acetylornithine deacetylase  33.76 
 
 
388 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150361  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  35.21 
 
 
406 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  35.21 
 
 
406 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  35.84 
 
 
389 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  34.9 
 
 
406 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  35.84 
 
 
389 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  35.31 
 
 
406 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  34.6 
 
 
406 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  35.84 
 
 
405 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  35.84 
 
 
405 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  35.84 
 
 
405 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  35.84 
 
 
405 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  35.84 
 
 
586 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  35.34 
 
 
387 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  33.83 
 
 
397 aa  179  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  34.69 
 
 
397 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.82 
 
 
388 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  34.6 
 
 
406 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>