More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2221 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2221  acetylornithine deacetylase  100 
 
 
378 aa  788    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0456385  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  82.23 
 
 
378 aa  659    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  81.43 
 
 
378 aa  654    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2755  acetylornithine deacetylase  73.81 
 
 
378 aa  575  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  57.52 
 
 
381 aa  481  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  58.05 
 
 
383 aa  481  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  58.07 
 
 
389 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  58.07 
 
 
387 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  58.07 
 
 
387 aa  478  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  57.78 
 
 
383 aa  479  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  56.88 
 
 
383 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  56.88 
 
 
383 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  56.88 
 
 
383 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  56.88 
 
 
383 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  56.88 
 
 
383 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  56.35 
 
 
383 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  56.35 
 
 
383 aa  474  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  56.35 
 
 
383 aa  474  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  56.35 
 
 
383 aa  472  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  56.35 
 
 
383 aa  472  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  56.35 
 
 
383 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  56.35 
 
 
383 aa  474  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  56.08 
 
 
383 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  56.32 
 
 
383 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  56.08 
 
 
383 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0194  acetylornithine deacetylase  57.78 
 
 
382 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  56.99 
 
 
383 aa  449  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  52.89 
 
 
382 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  49.87 
 
 
383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  48.81 
 
 
383 aa  398  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  48.81 
 
 
386 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  53.3 
 
 
382 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  48.03 
 
 
381 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  49.48 
 
 
383 aa  381  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  48.02 
 
 
387 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4277  acetylornithine deacetylase  49.47 
 
 
383 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00886468  normal  0.333205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  48.66 
 
 
383 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  48.02 
 
 
380 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  47.49 
 
 
380 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  47.23 
 
 
380 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  47.76 
 
 
388 aa  351  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  46.97 
 
 
380 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  45.29 
 
 
391 aa  349  5e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  46.17 
 
 
382 aa  342  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  45.91 
 
 
395 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  46.17 
 
 
382 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  46.44 
 
 
385 aa  336  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  44.33 
 
 
386 aa  335  9e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  44.74 
 
 
388 aa  334  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  45.74 
 
 
387 aa  335  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  45.12 
 
 
384 aa  332  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  44.88 
 
 
388 aa  330  3e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  44.59 
 
 
383 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  40.57 
 
 
389 aa  290  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1225  peptidase dimerization domain protein  42.97 
 
 
261 aa  201  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  34.49 
 
 
390 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  35.53 
 
 
386 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  34.58 
 
 
386 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  33.78 
 
 
428 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  34.58 
 
 
391 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  32.1 
 
 
397 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.43 
 
 
388 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  32.97 
 
 
388 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  34.64 
 
 
386 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  31.28 
 
 
397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  30.21 
 
 
385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  32.13 
 
 
392 aa  172  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  34.1 
 
 
390 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  31.1 
 
 
403 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  34.1 
 
 
387 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  31.99 
 
 
397 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  32.81 
 
 
387 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  31.78 
 
 
379 aa  170  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  32.44 
 
 
384 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.61 
 
 
402 aa  169  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  32.07 
 
 
382 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  32.97 
 
 
387 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  32.44 
 
 
384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  34.01 
 
 
380 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.98 
 
 
391 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.07 
 
 
389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  32.7 
 
 
387 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  31.48 
 
 
416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.45 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  31.02 
 
 
412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.69 
 
 
389 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  30.63 
 
 
387 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.17 
 
 
391 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  29.19 
 
 
374 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  32.34 
 
 
384 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32 
 
 
391 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  29.47 
 
 
376 aa  160  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  33.24 
 
 
389 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  31.37 
 
 
384 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  30.91 
 
 
385 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  31.53 
 
 
374 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.36 
 
 
392 aa  155  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.85 
 
 
393 aa  155  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.73 
 
 
392 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  30.39 
 
 
385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>