More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1359 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  100 
 
 
404 aa  833    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  88.86 
 
 
411 aa  745    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  69.53 
 
 
405 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  69.9 
 
 
406 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  69.53 
 
 
405 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  69.53 
 
 
405 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  69.53 
 
 
389 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  69.53 
 
 
405 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  69.53 
 
 
389 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  69.53 
 
 
586 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  70.68 
 
 
397 aa  570  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  67 
 
 
406 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  68.75 
 
 
405 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  70.05 
 
 
397 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  70.05 
 
 
397 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  67 
 
 
406 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  66.75 
 
 
406 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  68.67 
 
 
406 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  66.75 
 
 
406 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  68.93 
 
 
406 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  65.09 
 
 
404 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  67.1 
 
 
416 aa  554  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  64.47 
 
 
419 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  64.39 
 
 
398 aa  544  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  62.47 
 
 
398 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  65.7 
 
 
428 aa  515  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  52.03 
 
 
404 aa  421  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  50.64 
 
 
412 aa  409  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  54.03 
 
 
400 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  54.31 
 
 
400 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  50.26 
 
 
416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  48.85 
 
 
403 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  49.08 
 
 
384 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  49.22 
 
 
384 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  47.83 
 
 
392 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  48.96 
 
 
388 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  49.47 
 
 
388 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  50.53 
 
 
386 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  49.2 
 
 
389 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  49.21 
 
 
386 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  49.2 
 
 
386 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  49.35 
 
 
382 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  48.68 
 
 
391 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  48.83 
 
 
387 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  47.76 
 
 
387 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  50 
 
 
384 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  46.42 
 
 
388 aa  360  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  46.34 
 
 
406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  49.73 
 
 
384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  47.11 
 
 
386 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  47.35 
 
 
387 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  48.1 
 
 
387 aa  349  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  47.75 
 
 
392 aa  349  4e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  45.19 
 
 
390 aa  350  4e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  47.2 
 
 
390 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  46.54 
 
 
387 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  45.95 
 
 
402 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  44.62 
 
 
385 aa  315  7e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  44.36 
 
 
385 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  45.43 
 
 
386 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  45.08 
 
 
391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  45.08 
 
 
391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  45.53 
 
 
410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2601  acetylornithine deacetylase  46.09 
 
 
389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265053  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  43.96 
 
 
391 aa  296  5e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1579  acetylornithine deacetylase  44.15 
 
 
387 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.669783 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0237  acetylornithine deacetylase  43.39 
 
 
387 aa  288  8e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1880  acetylornithine deacetylase  43.39 
 
 
387 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  39.53 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7452  acetylornithine deacetylase (ArgE)  42.63 
 
 
397 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248803  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  38.36 
 
 
376 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4939  acetylornithine deacetylase  41.16 
 
 
424 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  41.56 
 
 
393 aa  280  4e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  41.86 
 
 
385 aa  279  6e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2313  acetylornithine deacetylase (ArgE)  42.38 
 
 
389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  40.84 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0717  acetylornithine deacetylase  40.62 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150361  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  40 
 
 
380 aa  270  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  39.15 
 
 
374 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  40.81 
 
 
376 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  37.27 
 
 
374 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5029  acetylornithine deacetylase  41.16 
 
 
373 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3291  acetylornithine deacetylase  41.51 
 
 
383 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  36.97 
 
 
379 aa  261  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  40.43 
 
 
374 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2582  acetylornithine deacetylase (ArgE)  46.56 
 
 
397 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  36.46 
 
 
375 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  34.79 
 
 
391 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  32.55 
 
 
381 aa  189  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  32.72 
 
 
383 aa  189  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  36.11 
 
 
383 aa  187  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  34.84 
 
 
383 aa  186  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  37.2 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  35.83 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.57 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  35.83 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  35.83 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  34.57 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  34.84 
 
 
383 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  34.84 
 
 
383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>