More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5672 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  91.73 
 
 		 387 aa  729    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  80.62 
 
 		 387 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  94.4 
 
 		 387 aa  724    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  82.08 
 
 		 388 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  87.08 
 
 		 387 aa  686    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  100 
 
 		 387 aa  784    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  98.45 
 
 		 390 aa  771    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  80.05 
 
 		 386 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  79.9 
 
 		 386 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  79.53 
 
 		 391 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  78.18 
 
 		 389 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  78.59 
 
 		 386 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  76.63 
 
 		 384 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  76.36 
 
 		 384 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  68.34 
 
 		 382 aa  527  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  59.84 
 
 		 390 aa  487  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  47.89 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  52.99 
 
 		 402 aa  378  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  47.58 
 
 		 403 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  47.34 
 
 		 398 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  47.64 
 
 		 428 aa  356  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  48.53 
 
 		 397 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  46.97 
 
 		 392 aa  355  7.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  48.27 
 
 		 397 aa  355  8.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  48.27 
 
 		 397 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  46.13 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  47.35 
 
 		 404 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  48.79 
 
 		 400 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  47.35 
 
 		 411 aa  349  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  48.53 
 
 		 400 aa  348  9e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  44.32 
 
 		 384 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  49.32 
 
 		 388 aa  343  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  43.78 
 
 		 384 aa  342  5e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  45.31 
 
 		 406 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  45.31 
 
 		 406 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  45.31 
 
 		 406 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  45.55 
 
 		 389 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  45.31 
 
 		 406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  45.31 
 
 		 406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  45.55 
 
 		 389 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  45.89 
 
 		 405 aa  338  9e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  45.89 
 
 		 405 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  45.89 
 
 		 405 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  45.89 
 
 		 405 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  45.57 
 
 		 405 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  45.89 
 
 		 586 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  45.04 
 
 		 406 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  45.04 
 
 		 406 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  45.97 
 
 		 404 aa  332  8e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  44.36 
 
 		 419 aa  332  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  44.71 
 
 		 406 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  43.57 
 
 		 404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  44.53 
 
 		 388 aa  327  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  43.5 
 
 		 416 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  43.9 
 
 		 412 aa  324  2e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  43.7 
 
 		 416 aa  323  3e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  45.58 
 
 		 386 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  46.25 
 
 		 386 aa  317  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  46.13 
 
 		 391 aa  316  5e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  46.21 
 
 		 391 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  44.85 
 
 		 385 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  42.2 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0237  acetylornithine deacetylase  43.9 
 
 		 387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3291  acetylornithine deacetylase  42.78 
 
 		 383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1880  acetylornithine deacetylase  43.72 
 
 		 387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  43.8 
 
 		 385 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  45.9 
 
 		 410 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  44.91 
 
 		 391 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  46.95 
 
 		 385 aa  299  5e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1579  acetylornithine deacetylase  43.12 
 
 		 387 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.669783 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  42.22 
 
 		 376 aa  292  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  43.15 
 
 		 380 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7452  acetylornithine deacetylase (ArgE)  43.36 
 
 		 397 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248803  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  43.09 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2601  acetylornithine deacetylase  41.07 
 
 		 389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  41.38 
 
 		 393 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4939  acetylornithine deacetylase  43.38 
 
 		 424 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  42.33 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  40.69 
 
 		 374 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2313  acetylornithine deacetylase (ArgE)  43 
 
 		 389 aa  277  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0717  acetylornithine deacetylase  38.9 
 
 		 388 aa  276  6e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  40.05 
 
 		 374 aa  276  7e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  43.24 
 
 		 375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  38.62 
 
 		 376 aa  272  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2582  acetylornithine deacetylase (ArgE)  44.47 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  39.73 
 
 		 374 aa  268  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5029  acetylornithine deacetylase  42.12 
 
 		 373 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  39.14 
 
 		 389 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  36.79 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  34.25 
 
 		 381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  36.01 
 
 		 383 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  36.34 
 
 		 388 aa  193  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  33.87 
 
 		 391 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  34.22 
 
 		 387 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  35.34 
 
 		 381 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  34.63 
 
 		 383 aa  190  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  35.8 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  35.9 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  37.1 
 
 		 383 aa  186  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  34.05 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>