More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1544 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  100 
 
 
374 aa  748    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  66.67 
 
 
374 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  67.48 
 
 
376 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  66.13 
 
 
374 aa  488  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5029  acetylornithine deacetylase  68.1 
 
 
373 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  64.34 
 
 
375 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  55.41 
 
 
376 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  55.05 
 
 
380 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  42.63 
 
 
402 aa  294  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  42.67 
 
 
391 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  42.41 
 
 
386 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  40.43 
 
 
382 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  43.16 
 
 
386 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  42.74 
 
 
384 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  40.75 
 
 
387 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  42.74 
 
 
384 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  42.37 
 
 
386 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  39.62 
 
 
389 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  40.05 
 
 
387 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  40.74 
 
 
387 aa  272  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  39.26 
 
 
388 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  39.26 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  38.98 
 
 
392 aa  270  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  39.26 
 
 
387 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  40.33 
 
 
387 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  39.89 
 
 
403 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  36.44 
 
 
390 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  40.43 
 
 
404 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  41.08 
 
 
419 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  40.16 
 
 
392 aa  259  8e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  40.21 
 
 
386 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  40.91 
 
 
404 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  39.89 
 
 
411 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  40.86 
 
 
388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  40.48 
 
 
416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  39.1 
 
 
410 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  39.63 
 
 
397 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  39.9 
 
 
397 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  39.26 
 
 
428 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  40.05 
 
 
397 aa  252  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  39.3 
 
 
385 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2582  acetylornithine deacetylase (ArgE)  44.74 
 
 
397 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  38.38 
 
 
406 aa  249  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  39.47 
 
 
385 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  40.73 
 
 
391 aa  246  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  38.92 
 
 
406 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  38.92 
 
 
406 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  38.92 
 
 
406 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  38.65 
 
 
406 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  38.65 
 
 
406 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  38.92 
 
 
406 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  40.22 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  39.53 
 
 
391 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  37.63 
 
 
406 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  36.43 
 
 
412 aa  238  1e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  40.16 
 
 
391 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  36.94 
 
 
400 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  35.09 
 
 
384 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  36.8 
 
 
389 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  36.8 
 
 
405 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  36.8 
 
 
405 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  36.8 
 
 
389 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  37.07 
 
 
405 aa  236  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  36.8 
 
 
405 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  36.8 
 
 
405 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  38.26 
 
 
392 aa  235  8e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  37.04 
 
 
400 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  36.8 
 
 
586 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  38.4 
 
 
393 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  35.99 
 
 
416 aa  231  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  35.26 
 
 
384 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  37.98 
 
 
398 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  37.27 
 
 
404 aa  229  5e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  38.64 
 
 
389 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7452  acetylornithine deacetylase (ArgE)  37.6 
 
 
397 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4939  acetylornithine deacetylase  38.68 
 
 
424 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  36.36 
 
 
379 aa  226  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2313  acetylornithine deacetylase (ArgE)  39.07 
 
 
389 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  38.03 
 
 
385 aa  224  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0717  acetylornithine deacetylase  34.65 
 
 
388 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150361  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2601  acetylornithine deacetylase  37.07 
 
 
389 aa  221  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265053  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0237  acetylornithine deacetylase  35.32 
 
 
387 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1579  acetylornithine deacetylase  34.95 
 
 
387 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.669783 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1880  acetylornithine deacetylase  35.32 
 
 
387 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3291  acetylornithine deacetylase  38.67 
 
 
383 aa  205  9e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  33.6 
 
 
386 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.7 
 
 
388 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  31.41 
 
 
391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  32.8 
 
 
382 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  34.34 
 
 
381 aa  187  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  33.33 
 
 
381 aa  187  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  34.15 
 
 
389 aa  185  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  34.15 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  34.15 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  33.33 
 
 
387 aa  182  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  32 
 
 
383 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  34.96 
 
 
383 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  33.15 
 
 
383 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  34.69 
 
 
383 aa  179  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  34.69 
 
 
383 aa  179  8e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>