More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1956 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  88.86 
 
 		 404 aa  745    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  100 
 
 		 411 aa  847    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  71.88 
 
 		 397 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  69.6 
 
 		 406 aa  578  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  71.88 
 
 		 397 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  71.99 
 
 		 397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  70.57 
 
 		 405 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  70.57 
 
 		 405 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  70.57 
 
 		 405 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  69.04 
 
 		 406 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  70.05 
 
 		 405 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  70.57 
 
 		 405 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  70.57 
 
 		 389 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  70.57 
 
 		 389 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  69.29 
 
 		 406 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  68.78 
 
 		 406 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  70.57 
 
 		 586 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  68.53 
 
 		 406 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  69.04 
 
 		 406 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  68.53 
 
 		 406 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  69.19 
 
 		 404 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  69.07 
 
 		 416 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  66.58 
 
 		 419 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  65.19 
 
 		 398 aa  541  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  62.2 
 
 		 398 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  64.91 
 
 		 428 aa  508  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  51.03 
 
 		 404 aa  420  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  50.39 
 
 		 412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  53.46 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  50.4 
 
 		 403 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  53.32 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  48.56 
 
 		 384 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  48.59 
 
 		 416 aa  395  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  48.7 
 
 		 384 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  49.73 
 
 		 386 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  48.43 
 
 		 392 aa  378  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  50 
 
 		 386 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  48.81 
 
 		 388 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  48.18 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  49.21 
 
 		 386 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  48.68 
 
 		 391 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  48.69 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  47.91 
 
 		 389 aa  362  6e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  50.55 
 
 		 384 aa  362  9e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  48.16 
 
 		 386 aa  361  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  48.83 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  50.55 
 
 		 384 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  48.83 
 
 		 387 aa  359  5e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  45.43 
 
 		 406 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  49.47 
 
 		 382 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  46.97 
 
 		 387 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  47.35 
 
 		 387 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  47.86 
 
 		 387 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  47.2 
 
 		 390 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  46.48 
 
 		 402 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  45.81 
 
 		 387 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  44.53 
 
 		 390 aa  338  9e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  44.44 
 
 		 385 aa  316  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  46.24 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  43.23 
 
 		 385 aa  309  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2601  acetylornithine deacetylase  45.97 
 
 		 389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  45.24 
 
 		 391 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  45.24 
 
 		 391 aa  301  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  45.26 
 
 		 410 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  41.15 
 
 		 392 aa  289  8e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  43.73 
 
 		 391 aa  286  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1880  acetylornithine deacetylase  43.54 
 
 		 387 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1579  acetylornithine deacetylase  43.65 
 
 		 387 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.669783 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0237  acetylornithine deacetylase  42.74 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7452  acetylornithine deacetylase (ArgE)  43.19 
 
 		 397 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248803  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  42.23 
 
 		 393 aa  279  8e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4939  acetylornithine deacetylase  41.3 
 
 		 424 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0717  acetylornithine deacetylase  42.28 
 
 		 388 aa  278  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  38.52 
 
 		 376 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2313  acetylornithine deacetylase (ArgE)  43.23 
 
 		 389 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  41.45 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  41.27 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  38.16 
 
 		 379 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  40.49 
 
 		 376 aa  267  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3291  acetylornithine deacetylase  39.43 
 
 		 383 aa  260  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  37.83 
 
 		 374 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  37.87 
 
 		 380 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5029  acetylornithine deacetylase  40.11 
 
 		 373 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  39.89 
 
 		 374 aa  256  5e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  36.75 
 
 		 374 aa  256  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2582  acetylornithine deacetylase (ArgE)  44.15 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  37.33 
 
 		 375 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  33.79 
 
 		 391 aa  196  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  34.82 
 
 		 381 aa  192  8e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  35.75 
 
 		 388 aa  183  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  31.85 
 
 		 383 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  34.81 
 
 		 383 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  34.3 
 
 		 383 aa  179  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  34.79 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.68 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  34.79 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  33.68 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  34.79 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  35.5 
 
 		 388 aa  178  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  34.04 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>