More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2747 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  97 
 
 		 400 aa  775    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  100 
 
 		 400 aa  819    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  59.64 
 
 		 403 aa  487  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  55.79 
 
 		 405 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  55.79 
 
 		 586 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  56.53 
 
 		 406 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  55.79 
 
 		 405 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  55.79 
 
 		 405 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  56.99 
 
 		 406 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  57.45 
 
 		 406 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  56.99 
 
 		 406 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  56.99 
 
 		 406 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  57.52 
 
 		 406 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  56.99 
 
 		 406 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  55.79 
 
 		 405 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  55.79 
 
 		 389 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  55.79 
 
 		 389 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  54.31 
 
 		 404 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  55.26 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  54.62 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  53.46 
 
 		 411 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  54.35 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  51.85 
 
 		 406 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  53.99 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  52.34 
 
 		 419 aa  391  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  52.36 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  52.14 
 
 		 388 aa  388  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  50.65 
 
 		 404 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  53.21 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  51.86 
 
 		 416 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  50.53 
 
 		 386 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  51.99 
 
 		 398 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  49.47 
 
 		 388 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  51.64 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  49.74 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  51.37 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  49.6 
 
 		 389 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  48.81 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  48.13 
 
 		 382 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  48.79 
 
 		 387 aa  358  8e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  49.19 
 
 		 386 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  49.34 
 
 		 402 aa  358  9.999999999999999e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  48.79 
 
 		 387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  49.46 
 
 		 387 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  47.06 
 
 		 387 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  46.77 
 
 		 390 aa  355  5.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  48.53 
 
 		 390 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  48.51 
 
 		 386 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  48.51 
 
 		 386 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  48.24 
 
 		 391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  49.06 
 
 		 387 aa  353  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  45.91 
 
 		 384 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  47.73 
 
 		 392 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  45.38 
 
 		 384 aa  344  1e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  45.91 
 
 		 416 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  46.17 
 
 		 385 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  45.61 
 
 		 412 aa  335  1e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  45.74 
 
 		 404 aa  335  1e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  45.12 
 
 		 385 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  44.33 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  46.32 
 
 		 410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4939  acetylornithine deacetylase  41.33 
 
 		 424 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  41.87 
 
 		 392 aa  282  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  44.44 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  41.39 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  43.92 
 
 		 391 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2601  acetylornithine deacetylase  41.82 
 
 		 389 aa  280  4e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  43.42 
 
 		 385 aa  279  5e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  43.95 
 
 		 391 aa  277  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7452  acetylornithine deacetylase (ArgE)  43.05 
 
 		 397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  40.69 
 
 		 380 aa  265  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3291  acetylornithine deacetylase  42.59 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  40.9 
 
 		 389 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  37.67 
 
 		 379 aa  258  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  38.02 
 
 		 376 aa  257  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  38.3 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1579  acetylornithine deacetylase  41.01 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.669783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2313  acetylornithine deacetylase (ArgE)  41.32 
 
 		 389 aa  248  9e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  40.21 
 
 		 376 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  35.7 
 
 		 374 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0237  acetylornithine deacetylase  40.69 
 
 		 387 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1880  acetylornithine deacetylase  40.69 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2582  acetylornithine deacetylase (ArgE)  44.25 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  36.6 
 
 		 374 aa  239  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5029  acetylornithine deacetylase  39.58 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0717  acetylornithine deacetylase  37.27 
 
 		 388 aa  237  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  36.15 
 
 		 375 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  37.5 
 
 		 388 aa  206  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  33.15 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  35.44 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  35.42 
 
 		 389 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  34.33 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.06 
 
 		 383 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  34.06 
 
 		 383 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  34.06 
 
 		 383 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  34.06 
 
 		 383 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  34.06 
 
 		 383 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  32.81 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  34.06 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  34.06 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>