More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4976 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  100 
 
 		 376 aa  753    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  56.56 
 
 		 376 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  55 
 
 		 380 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  55.41 
 
 		 374 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  55.73 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  51.35 
 
 		 374 aa  360  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  52.39 
 
 		 374 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5029  acetylornithine deacetylase  54.32 
 
 		 373 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  45.84 
 
 		 391 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  45.31 
 
 		 386 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  45.04 
 
 		 386 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  44.32 
 
 		 386 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  45.08 
 
 		 384 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  45.08 
 
 		 384 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  43.5 
 
 		 382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  42.45 
 
 		 402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  42.89 
 
 		 389 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  42.78 
 
 		 388 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  40.16 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  43.04 
 
 		 387 aa  296  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  42.22 
 
 		 387 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  41.97 
 
 		 387 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  41.95 
 
 		 387 aa  291  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  41.95 
 
 		 390 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  41.67 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  41.41 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  41.78 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  41.25 
 
 		 416 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  41.46 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  43.35 
 
 		 398 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  40.48 
 
 		 419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  40.21 
 
 		 404 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  41.36 
 
 		 406 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  41.36 
 
 		 406 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  41.1 
 
 		 406 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  40.42 
 
 		 406 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  41.36 
 
 		 406 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  42.05 
 
 		 406 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  42.05 
 
 		 406 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  45.06 
 
 		 410 aa  269  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  41.98 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  40.81 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  40.49 
 
 		 411 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  42.69 
 
 		 406 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  41.18 
 
 		 389 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  41.18 
 
 		 389 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  41.18 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  41.18 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  41.18 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  41.18 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  41.18 
 
 		 586 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  41.03 
 
 		 397 aa  262  8e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2582  acetylornithine deacetylase (ArgE)  43.6 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  41.03 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  39.31 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  41.05 
 
 		 388 aa  259  7e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  39.51 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  39.71 
 
 		 404 aa  257  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  42.39 
 
 		 397 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  39.58 
 
 		 386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  41.22 
 
 		 391 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  41.22 
 
 		 391 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  36.53 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  39.84 
 
 		 385 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  39.53 
 
 		 412 aa  250  3e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  39.87 
 
 		 384 aa  249  5e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  39.47 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  41.94 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7452  acetylornithine deacetylase (ArgE)  40.58 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248803  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  42.33 
 
 		 389 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  36.72 
 
 		 416 aa  247  3e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  39.4 
 
 		 385 aa  246  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  38.61 
 
 		 385 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  38.52 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  40.21 
 
 		 400 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  40.16 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2313  acetylornithine deacetylase (ArgE)  39.35 
 
 		 389 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2601  acetylornithine deacetylase  38.69 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  35.6 
 
 		 379 aa  229  8e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1579  acetylornithine deacetylase  38.63 
 
 		 387 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.669783 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1880  acetylornithine deacetylase  37.73 
 
 		 387 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0237  acetylornithine deacetylase  37.73 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3291  acetylornithine deacetylase  36.17 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  35.95 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  36.83 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0717  acetylornithine deacetylase  35.86 
 
 		 388 aa  216  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4939  acetylornithine deacetylase  39.47 
 
 		 424 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  36.05 
 
 		 388 aa  182  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  31.96 
 
 		 381 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  30.5 
 
 		 391 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  33.59 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  33.68 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  33.61 
 
 		 381 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  33.87 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  30.53 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  33.42 
 
 		 380 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  31.33 
 
 		 387 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  30.89 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  34.4 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  31.97 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>