More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2045 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  100 
 
 
389 aa  775    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  62.05 
 
 
388 aa  463  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  57.92 
 
 
386 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  54.08 
 
 
388 aa  388  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  51.95 
 
 
387 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  46.13 
 
 
391 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  48.31 
 
 
387 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  50.64 
 
 
395 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  49.74 
 
 
382 aa  361  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  50.26 
 
 
382 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  50.77 
 
 
388 aa  359  4e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  49.35 
 
 
380 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  48.84 
 
 
380 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  48.32 
 
 
380 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  49.22 
 
 
380 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  48.45 
 
 
384 aa  349  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  50.91 
 
 
385 aa  349  6e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  48.32 
 
 
383 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  42.93 
 
 
386 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  42.12 
 
 
381 aa  334  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  42.97 
 
 
383 aa  334  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  41.41 
 
 
383 aa  329  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4277  acetylornithine deacetylase  41.15 
 
 
383 aa  327  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00886468  normal  0.333205 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  42.67 
 
 
382 aa  322  8e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  43.81 
 
 
383 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  43.56 
 
 
383 aa  319  7e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  40.1 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  40.05 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  44.39 
 
 
383 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  44.39 
 
 
383 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  44.39 
 
 
383 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  44.39 
 
 
383 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  44.39 
 
 
383 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  44.39 
 
 
383 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  44.39 
 
 
383 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  44.39 
 
 
383 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  44.39 
 
 
383 aa  311  9e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  43.08 
 
 
383 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  43.08 
 
 
383 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  43.08 
 
 
383 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  43.08 
 
 
383 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  42.82 
 
 
383 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  42.78 
 
 
383 aa  306  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  42.16 
 
 
389 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  42.53 
 
 
383 aa  304  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  42.45 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  42.45 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0194  acetylornithine deacetylase  41.49 
 
 
382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  42.04 
 
 
381 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  39.58 
 
 
382 aa  294  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  40.47 
 
 
378 aa  280  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  40.47 
 
 
378 aa  277  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2221  acetylornithine deacetylase  39.28 
 
 
378 aa  263  4e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0456385  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2755  acetylornithine deacetylase  38.62 
 
 
378 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1225  peptidase dimerization domain protein  50.2 
 
 
261 aa  243  6e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  35.79 
 
 
374 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  39.42 
 
 
389 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  36.79 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  37.05 
 
 
390 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  35.53 
 
 
391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  35.98 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  35.73 
 
 
386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  35.51 
 
 
389 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  35.4 
 
 
386 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  34.45 
 
 
379 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  38.14 
 
 
388 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  34.46 
 
 
386 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  35.75 
 
 
387 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  33.86 
 
 
376 aa  189  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  35.19 
 
 
400 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  36.27 
 
 
387 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  36.08 
 
 
387 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0568  acetylornithine deacetylase  42.64 
 
 
371 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.783579  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  33.88 
 
 
382 aa  186  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  32.9 
 
 
403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.43 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  30.75 
 
 
390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  34.32 
 
 
374 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  35.06 
 
 
387 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0595  acetylornithine deacetylase (ArgE)  42.04 
 
 
371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0603  acetylornithine deacetylase (ArgE)  41.74 
 
 
371 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  34.25 
 
 
397 aa  179  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  34.21 
 
 
384 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  34.13 
 
 
384 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  35.22 
 
 
402 aa  176  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  35.64 
 
 
380 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  32.61 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  32.61 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  32.61 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  32.61 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  32.61 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  32.61 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  33.14 
 
 
404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  33.93 
 
 
586 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  33.13 
 
 
411 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  32.07 
 
 
405 aa  172  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  32.37 
 
 
374 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  32.05 
 
 
384 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  31.61 
 
 
406 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  31.61 
 
 
406 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>