More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0573 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  100 
 
 
386 aa  781    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  66.4 
 
 
388 aa  507  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  59.1 
 
 
387 aa  468  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  58.51 
 
 
388 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  54.84 
 
 
387 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  57.92 
 
 
389 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  57.22 
 
 
395 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  56.84 
 
 
382 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  57.22 
 
 
382 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  55.67 
 
 
380 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  55.67 
 
 
380 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  55.53 
 
 
380 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  56.54 
 
 
384 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  56.2 
 
 
380 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  58.64 
 
 
385 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  55.41 
 
 
388 aa  408  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  49.87 
 
 
391 aa  411  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  55.5 
 
 
383 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  48.04 
 
 
383 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  46.48 
 
 
383 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  48.02 
 
 
382 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  48.28 
 
 
381 aa  360  3e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  48.55 
 
 
383 aa  359  4e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  48.81 
 
 
383 aa  359  5e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  45.95 
 
 
386 aa  358  7e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  50.26 
 
 
383 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  50.26 
 
 
383 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  46.48 
 
 
383 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  50.26 
 
 
383 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  50.26 
 
 
383 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  50.26 
 
 
383 aa  352  5e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  50.26 
 
 
383 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  49.08 
 
 
383 aa  352  5.9999999999999994e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  50.26 
 
 
383 aa  352  7e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  50.26 
 
 
383 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  50 
 
 
383 aa  351  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  47.66 
 
 
389 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  47.66 
 
 
387 aa  348  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  47.66 
 
 
387 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4277  acetylornithine deacetylase  48.96 
 
 
383 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00886468  normal  0.333205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  48.15 
 
 
383 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  48.15 
 
 
383 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  48.15 
 
 
383 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  48.15 
 
 
383 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  48.15 
 
 
383 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  46.17 
 
 
378 aa  341  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  48.81 
 
 
383 aa  340  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  45.93 
 
 
378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0194  acetylornithine deacetylase  48.68 
 
 
382 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  46.09 
 
 
383 aa  329  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  45.43 
 
 
382 aa  325  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  41.73 
 
 
381 aa  323  4e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2755  acetylornithine deacetylase  47.11 
 
 
378 aa  316  4e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2221  acetylornithine deacetylase  44.33 
 
 
378 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0456385  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1225  peptidase dimerization domain protein  49.4 
 
 
261 aa  257  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  36.03 
 
 
376 aa  196  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  34.22 
 
 
374 aa  193  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  38.24 
 
 
389 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  35.19 
 
 
416 aa  189  7e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  35.7 
 
 
379 aa  188  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1228  acetylornithine deacetylase  68.99 
 
 
133 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  34.45 
 
 
412 aa  184  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  36.29 
 
 
375 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  36.62 
 
 
374 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  35.14 
 
 
386 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  35.88 
 
 
428 aa  178  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  35.59 
 
 
398 aa  176  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  34.7 
 
 
403 aa  176  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  34.11 
 
 
391 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.01 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.4 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  33.93 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  34.2 
 
 
374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  34.03 
 
 
387 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  34.39 
 
 
397 aa  172  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  34.79 
 
 
387 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  33.85 
 
 
390 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0568  acetylornithine deacetylase  38.66 
 
 
371 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.783579  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  31.17 
 
 
390 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  35.22 
 
 
386 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  34.36 
 
 
387 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  33.7 
 
 
405 aa  171  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  35.4 
 
 
404 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  34.32 
 
 
389 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  34.32 
 
 
389 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  34.32 
 
 
405 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  34.32 
 
 
405 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  34.32 
 
 
405 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  34.32 
 
 
405 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  34.32 
 
 
586 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  33.78 
 
 
406 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  33.42 
 
 
397 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  33.6 
 
 
406 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  33.6 
 
 
406 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  34.02 
 
 
385 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  31.14 
 
 
392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  33.6 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0603  acetylornithine deacetylase (ArgE)  35.84 
 
 
371 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0595  acetylornithine deacetylase (ArgE)  36.1 
 
 
371 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  35.31 
 
 
386 aa  167  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.811427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>