More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5950 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  100 
 
 
383 aa  776    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  94.78 
 
 
384 aa  742    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  78.22 
 
 
395 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  77.57 
 
 
382 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  77.04 
 
 
380 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  78.68 
 
 
388 aa  616  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  75.99 
 
 
380 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  77.43 
 
 
382 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  76.05 
 
 
380 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  75.2 
 
 
380 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  78.8 
 
 
385 aa  589  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  60.42 
 
 
387 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  52.93 
 
 
387 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  55.5 
 
 
386 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  51.83 
 
 
391 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  54.86 
 
 
388 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  55.09 
 
 
388 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  48.81 
 
 
386 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  46.7 
 
 
383 aa  364  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  47.49 
 
 
383 aa  363  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  46.58 
 
 
383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  48.42 
 
 
381 aa  356  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  48.29 
 
 
383 aa  355  5.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  48.29 
 
 
383 aa  355  8.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  46.72 
 
 
382 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  47.77 
 
 
383 aa  352  5e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  49.34 
 
 
383 aa  350  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  49.34 
 
 
383 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  49.34 
 
 
383 aa  349  4e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  49.34 
 
 
383 aa  349  5e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  49.34 
 
 
383 aa  348  6e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  49.34 
 
 
383 aa  348  6e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  49.34 
 
 
383 aa  348  6e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  47.49 
 
 
382 aa  348  8e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4277  acetylornithine deacetylase  46.44 
 
 
383 aa  348  8e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00886468  normal  0.333205 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  49.34 
 
 
383 aa  348  8e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  49.34 
 
 
383 aa  348  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  46.17 
 
 
383 aa  348  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  48.02 
 
 
383 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  48.02 
 
 
383 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  48.02 
 
 
383 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  48.02 
 
 
383 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  48.02 
 
 
383 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  48.32 
 
 
389 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  47.03 
 
 
389 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  47.03 
 
 
387 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  47.03 
 
 
387 aa  340  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  43.6 
 
 
381 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  47.51 
 
 
383 aa  331  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  46.03 
 
 
378 aa  330  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0194  acetylornithine deacetylase  47.24 
 
 
382 aa  329  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  44.97 
 
 
378 aa  324  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2755  acetylornithine deacetylase  45.65 
 
 
378 aa  308  9e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2221  acetylornithine deacetylase  44.59 
 
 
378 aa  291  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0456385  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1225  peptidase dimerization domain protein  47.81 
 
 
261 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  37.93 
 
 
389 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  35.69 
 
 
392 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  34.63 
 
 
387 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  33.06 
 
 
397 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  33.97 
 
 
386 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  34.29 
 
 
375 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  33.7 
 
 
386 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  33.7 
 
 
391 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  33.7 
 
 
379 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  32.8 
 
 
397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  34.99 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  35.98 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  33.78 
 
 
397 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  31.11 
 
 
382 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  32.89 
 
 
384 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  32.13 
 
 
398 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  33.07 
 
 
384 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  32.97 
 
 
388 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  35.37 
 
 
411 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  32.88 
 
 
386 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4939  acetylornithine deacetylase  34.9 
 
 
424 aa  169  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  30 
 
 
390 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  34.52 
 
 
406 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  32.97 
 
 
386 aa  169  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  32.87 
 
 
387 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  33.43 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  35.71 
 
 
386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  34.23 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  31.88 
 
 
428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  32.87 
 
 
390 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  33.63 
 
 
406 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  33.63 
 
 
406 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  32.69 
 
 
387 aa  166  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  33.51 
 
 
374 aa  166  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  32.35 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.51 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  30.36 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  32.89 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  33.13 
 
 
406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  32.45 
 
 
389 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  32.61 
 
 
405 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  32.45 
 
 
389 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  32.61 
 
 
405 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  32.84 
 
 
406 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  32.61 
 
 
405 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>