More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1225 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1225  peptidase dimerization domain protein  100 
 
 
261 aa  540  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  52.19 
 
 
387 aa  264  8.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  49.4 
 
 
386 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  49.2 
 
 
380 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  48.19 
 
 
380 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  49.4 
 
 
384 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  48.59 
 
 
380 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  49 
 
 
382 aa  245  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  50.2 
 
 
388 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  48.61 
 
 
395 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  48 
 
 
382 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  50.2 
 
 
389 aa  243  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  48.41 
 
 
388 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  46.85 
 
 
380 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  47.2 
 
 
388 aa  236  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  47.81 
 
 
387 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  45.6 
 
 
391 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  47.81 
 
 
383 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  44.18 
 
 
386 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4277  acetylornithine deacetylase  43.08 
 
 
383 aa  226  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00886468  normal  0.333205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  47.41 
 
 
385 aa  225  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  44.18 
 
 
383 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  42.31 
 
 
383 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  43.78 
 
 
383 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  43.37 
 
 
382 aa  215  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  42.31 
 
 
383 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2755  acetylornithine deacetylase  43.78 
 
 
378 aa  210  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  42.64 
 
 
382 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  41.37 
 
 
381 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2221  acetylornithine deacetylase  42.97 
 
 
378 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0456385  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  43.15 
 
 
383 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  41.53 
 
 
389 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  41.53 
 
 
387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  41.53 
 
 
387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  40.96 
 
 
381 aa  195  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0194  acetylornithine deacetylase  41.94 
 
 
382 aa  193  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  42.57 
 
 
378 aa  192  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  42.17 
 
 
378 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  40.32 
 
 
383 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  40.96 
 
 
383 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  40.32 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  40.96 
 
 
383 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  40.96 
 
 
383 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  40.96 
 
 
383 aa  182  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  40.96 
 
 
383 aa  182  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  40.96 
 
 
383 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.268381 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  40.96 
 
 
383 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  40.96 
 
 
383 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  40.96 
 
 
383 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  40.96 
 
 
383 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  40.96 
 
 
383 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  40.96 
 
 
383 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  40.96 
 
 
383 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  40.96 
 
 
383 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  40.16 
 
 
383 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  35.74 
 
 
389 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  35.6 
 
 
374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  34.22 
 
 
375 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0568  acetylornithine deacetylase  34.14 
 
 
371 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.783579  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0603  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.33 
 
 
371 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0595  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.6 
 
 
371 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  35.41 
 
 
380 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  31.56 
 
 
390 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  35.16 
 
 
388 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  33.2 
 
 
374 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  35.55 
 
 
387 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  34.12 
 
 
428 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.2 
 
 
393 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7452  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.97 
 
 
397 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248803  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  33.46 
 
 
376 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  33.33 
 
 
382 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  34.11 
 
 
387 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  33.2 
 
 
403 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.83 
 
 
392 aa  119  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.12 
 
 
388 aa  118  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  32.43 
 
 
416 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  33.98 
 
 
386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.33 
 
 
391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  34.82 
 
 
384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4939  acetylornithine deacetylase  30.92 
 
 
424 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.44 
 
 
391 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  33.72 
 
 
390 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.44 
 
 
391 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  31.92 
 
 
412 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  31.15 
 
 
586 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  33.72 
 
 
387 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  31.15 
 
 
405 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  31.15 
 
 
405 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  31.15 
 
 
405 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  31.15 
 
 
405 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  31.15 
 
 
389 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  33.46 
 
 
386 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  31.15 
 
 
389 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  32.68 
 
 
386 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  32.68 
 
 
391 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  30.38 
 
 
397 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.22 
 
 
400 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  30.47 
 
 
406 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  30.47 
 
 
406 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.62 
 
 
398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>