More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0323 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  81.53 
 
 		 380 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  100 
 
 		 382 aa  778    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  96.34 
 
 		 395 aa  757    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  86.28 
 
 		 382 aa  683    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  84.21 
 
 		 388 aa  662    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  83.64 
 
 		 380 aa  654    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  83.16 
 
 		 380 aa  660    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  82.32 
 
 		 380 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  77.95 
 
 		 384 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  77.43 
 
 		 383 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  78.48 
 
 		 385 aa  590  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  61.74 
 
 		 387 aa  490  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  55.32 
 
 		 387 aa  428  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  57.22 
 
 		 386 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  52.62 
 
 		 391 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  55 
 
 		 388 aa  412  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  54.97 
 
 		 388 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  51.72 
 
 		 386 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  50.13 
 
 		 383 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  50.66 
 
 		 382 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  48.28 
 
 		 383 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  48.28 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  49.21 
 
 		 383 aa  368  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  49.47 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4277  acetylornithine deacetylase  49.87 
 
 		 383 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00886468  normal  0.333205 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  49.21 
 
 		 383 aa  364  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  48.28 
 
 		 383 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  49.34 
 
 		 382 aa  363  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  49.74 
 
 		 383 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  49.74 
 
 		 383 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  49.74 
 
 		 383 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  49.74 
 
 		 383 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  49.74 
 
 		 383 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  46.46 
 
 		 381 aa  361  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  50.26 
 
 		 389 aa  360  3e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  47.89 
 
 		 381 aa  358  9e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  49.74 
 
 		 383 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  49.74 
 
 		 383 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  49.74 
 
 		 383 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  49.74 
 
 		 383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  49.74 
 
 		 383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  49.74 
 
 		 383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  49.74 
 
 		 383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  49.74 
 
 		 383 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  49.47 
 
 		 383 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  47.27 
 
 		 387 aa  355  7.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  47.27 
 
 		 387 aa  355  7.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  47.27 
 
 		 389 aa  355  7.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  49.74 
 
 		 383 aa  352  5e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0194  acetylornithine deacetylase  49.74 
 
 		 382 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  46.56 
 
 		 378 aa  330  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  45.77 
 
 		 378 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2755  acetylornithine deacetylase  45.65 
 
 		 378 aa  311  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2221  acetylornithine deacetylase  46.17 
 
 		 378 aa  306  3e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0456385  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1225  peptidase dimerization domain protein  49 
 
 		 261 aa  245  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  38.2 
 
 		 389 aa  205  9e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  35.39 
 
 		 374 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  34.6 
 
 		 386 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  32.8 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  33.88 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0568  acetylornithine deacetylase  37.43 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.783579  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  33.7 
 
 		 388 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  34.33 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0595  acetylornithine deacetylase (ArgE)  37.4 
 
 		 371 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  32.22 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  32.53 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  33.33 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  32.72 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.49 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  33.42 
 
 		 375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  32.97 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  34.2 
 
 		 374 aa  172  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0603  acetylornithine deacetylase (ArgE)  36.59 
 
 		 371 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  33.42 
 
 		 397 aa  172  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  33.33 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  34.43 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  33.43 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  33.43 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  33.43 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  33.43 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  32.94 
 
 		 389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  31.88 
 
 		 428 aa  166  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  32.94 
 
 		 389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  32.6 
 
 		 390 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  31.93 
 
 		 586 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  32.37 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  32.42 
 
 		 386 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  34.46 
 
 		 380 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  34.32 
 
 		 404 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  35.28 
 
 		 386 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  32.08 
 
 		 405 aa  163  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  32.02 
 
 		 389 aa  163  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4939  acetylornithine deacetylase  34.53 
 
 		 424 aa  162  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  31.66 
 
 		 384 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2313  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.79 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  29.56 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.24 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  32.45 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  31.57 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  33.95 
 
 		 384 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>