More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4061 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  83.29 
 
 		 383 aa  681    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  83.55 
 
 		 383 aa  682    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  83.55 
 
 		 383 aa  684    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  81.46 
 
 		 383 aa  674    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0194  acetylornithine deacetylase  85.56 
 
 		 382 aa  676    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  81.72 
 
 		 383 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  83.03 
 
 		 383 aa  679    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  80.31 
 
 		 387 aa  659    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  83.55 
 
 		 383 aa  682    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  100 
 
 		 383 aa  791    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  83.03 
 
 		 383 aa  678    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  83.55 
 
 		 383 aa  682    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  81.72 
 
 		 383 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  83.29 
 
 		 383 aa  682    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  81.72 
 
 		 383 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  81.72 
 
 		 383 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  87.47 
 
 		 383 aa  689    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  83.55 
 
 		 383 aa  684    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  80.41 
 
 		 389 aa  663    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  81.72 
 
 		 383 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  98.96 
 
 		 383 aa  784    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  80.31 
 
 		 387 aa  659    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  78.22 
 
 		 381 aa  650    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  62.89 
 
 		 378 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  62.37 
 
 		 378 aa  485  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  57.07 
 
 		 386 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  57.67 
 
 		 383 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  55.56 
 
 		 383 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  57.37 
 
 		 382 aa  450  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2755  acetylornithine deacetylase  59.1 
 
 		 378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2221  acetylornithine deacetylase  58.05 
 
 		 378 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0456385  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  54.23 
 
 		 383 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  53.87 
 
 		 381 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4277  acetylornithine deacetylase  55.56 
 
 		 383 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00886468  normal  0.333205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  55.26 
 
 		 383 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  52.91 
 
 		 382 aa  406  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  49.21 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  50.66 
 
 		 380 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  49.35 
 
 		 380 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  49.61 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  49.87 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  49.09 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  49.21 
 
 		 382 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  49.1 
 
 		 388 aa  365  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  49.21 
 
 		 395 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  46.03 
 
 		 391 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  47.2 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  49.21 
 
 		 388 aa  368  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  48.55 
 
 		 386 aa  359  4e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  48.03 
 
 		 388 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  46.98 
 
 		 384 aa  352  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  47.77 
 
 		 383 aa  352  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  48.56 
 
 		 385 aa  349  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  43.56 
 
 		 389 aa  319  6e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  33.16 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  34.65 
 
 		 386 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  34.65 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1225  peptidase dimerization domain protein  40.32 
 
 		 261 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  33.61 
 
 		 388 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  34.12 
 
 		 386 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  33.42 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  34.38 
 
 		 386 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  31.96 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  32.37 
 
 		 416 aa  180  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  33.15 
 
 		 374 aa  179  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  32.53 
 
 		 397 aa  179  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  34.17 
 
 		 428 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  33.43 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.76 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  33.42 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  33.07 
 
 		 404 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  32.9 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  35.01 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  32.98 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  33.24 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  34.13 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  34.44 
 
 		 390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  34.16 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  33.51 
 
 		 384 aa  172  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  31.81 
 
 		 397 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  29.95 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  33.62 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  33.07 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  33.78 
 
 		 385 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  32.07 
 
 		 382 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  30.37 
 
 		 376 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.8 
 
 		 391 aa  169  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  32.6 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.77 
 
 		 400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.7 
 
 		 400 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  32.24 
 
 		 387 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  32.23 
 
 		 404 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.16 
 
 		 388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  31.93 
 
 		 411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.24 
 
 		 391 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.96 
 
 		 391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.44 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  32.34 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.78 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  31.74 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>