More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1104 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  100 
 
 
391 aa  812    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  55.79 
 
 
387 aa  465  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  58.87 
 
 
387 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  53.02 
 
 
380 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  53.66 
 
 
380 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  53.14 
 
 
380 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  52.37 
 
 
382 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  52.51 
 
 
395 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  53.14 
 
 
380 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  52.62 
 
 
382 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  52.59 
 
 
388 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  49.87 
 
 
386 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  51.85 
 
 
388 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  51.98 
 
 
384 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  51.83 
 
 
383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  50.39 
 
 
388 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  48.04 
 
 
383 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  51.84 
 
 
385 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  46.48 
 
 
383 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  47.78 
 
 
383 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  47.78 
 
 
387 aa  388  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  47.78 
 
 
387 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  47.78 
 
 
389 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  45.43 
 
 
386 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  48.42 
 
 
382 aa  383  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  46.07 
 
 
381 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  46.56 
 
 
381 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4277  acetylornithine deacetylase  48.83 
 
 
383 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00886468  normal  0.333205 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  46.83 
 
 
383 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  46.13 
 
 
389 aa  373  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  47.23 
 
 
383 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  46.97 
 
 
383 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  47.23 
 
 
383 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  47.35 
 
 
383 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  47.23 
 
 
383 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  46.56 
 
 
383 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  46.56 
 
 
383 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  46.56 
 
 
383 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  46.56 
 
 
383 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  46.56 
 
 
383 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  46.56 
 
 
383 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  46.3 
 
 
383 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  46.56 
 
 
383 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  46.56 
 
 
383 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  47.26 
 
 
383 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  46.03 
 
 
383 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  46.03 
 
 
383 aa  365  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  45.55 
 
 
382 aa  358  9e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0194  acetylornithine deacetylase  47.62 
 
 
382 aa  355  8.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  46.83 
 
 
383 aa  352  8.999999999999999e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  45.24 
 
 
378 aa  341  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  44.71 
 
 
378 aa  338  8e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2221  acetylornithine deacetylase  45.29 
 
 
378 aa  316  5e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0456385  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2755  acetylornithine deacetylase  43.8 
 
 
378 aa  310  4e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1225  peptidase dimerization domain protein  45.6 
 
 
261 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.33 
 
 
388 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  35.08 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  35.08 
 
 
391 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  34.82 
 
 
386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  34.73 
 
 
390 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  34.55 
 
 
386 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  33.77 
 
 
392 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  35.43 
 
 
382 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  34.79 
 
 
404 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  35.31 
 
 
388 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  32.62 
 
 
374 aa  202  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  33.79 
 
 
586 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  35.41 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  33.7 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  33.7 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  32.83 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  33.7 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  32.83 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  33.7 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  34.2 
 
 
403 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  33.25 
 
 
387 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.42 
 
 
389 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  34.17 
 
 
412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  33.95 
 
 
384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  34.25 
 
 
428 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  35.29 
 
 
397 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  34.23 
 
 
387 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  35.22 
 
 
387 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  33.79 
 
 
411 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  31.73 
 
 
405 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  34.24 
 
 
404 aa  195  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  32.58 
 
 
416 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  34.95 
 
 
387 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  35.57 
 
 
397 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  34.15 
 
 
406 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  32.33 
 
 
384 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  33.78 
 
 
384 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.42 
 
 
393 aa  193  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  33.88 
 
 
406 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  35.73 
 
 
404 aa  192  6e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  31.13 
 
 
376 aa  192  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  33.87 
 
 
390 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  32.69 
 
 
406 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  35.01 
 
 
397 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  33.87 
 
 
387 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>