More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_71180 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  98.18 
 
 
384 aa  759    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  100 
 
 
384 aa  772    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  75.26 
 
 
386 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  76.19 
 
 
387 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  75 
 
 
386 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  75.93 
 
 
387 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  75.66 
 
 
390 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  74.47 
 
 
386 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  73.95 
 
 
391 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  74.6 
 
 
388 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  75.95 
 
 
387 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  73.42 
 
 
387 aa  567  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  71.96 
 
 
387 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  71.65 
 
 
389 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  71.47 
 
 
382 aa  554  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  58.62 
 
 
390 aa  476  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  56.05 
 
 
402 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  48.03 
 
 
392 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  48.79 
 
 
403 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  50.13 
 
 
397 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  49.21 
 
 
428 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  49.6 
 
 
404 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  49.87 
 
 
397 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  50.27 
 
 
398 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  49.87 
 
 
411 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  49.33 
 
 
406 aa  362  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  49.33 
 
 
406 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  50.92 
 
 
400 aa  362  6e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  48.53 
 
 
406 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  50.66 
 
 
400 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  48.26 
 
 
406 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  48.26 
 
 
406 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  48.26 
 
 
406 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  49.34 
 
 
405 aa  358  7e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  48.26 
 
 
406 aa  358  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  49.08 
 
 
389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  49.08 
 
 
405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  49.08 
 
 
405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  49.08 
 
 
405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  49.08 
 
 
389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  49.08 
 
 
405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  49.08 
 
 
586 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  48.92 
 
 
398 aa  354  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  46.83 
 
 
392 aa  354  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  49.47 
 
 
397 aa  352  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  45.91 
 
 
419 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  51.22 
 
 
388 aa  345  6e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  46.44 
 
 
404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  46.7 
 
 
416 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  45.83 
 
 
385 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  45.05 
 
 
385 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  42.33 
 
 
384 aa  329  4e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  43.01 
 
 
384 aa  329  4e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  47.79 
 
 
386 aa  328  9e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  45.17 
 
 
404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  44.71 
 
 
406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  44.07 
 
 
416 aa  324  2e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  44.44 
 
 
388 aa  322  7e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  43.6 
 
 
412 aa  320  3e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  48.83 
 
 
385 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  44.47 
 
 
376 aa  311  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  44.57 
 
 
386 aa  311  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  48.63 
 
 
410 aa  309  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  45.55 
 
 
380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3291  acetylornithine deacetylase  42.25 
 
 
383 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  40.05 
 
 
379 aa  296  5e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2601  acetylornithine deacetylase  43.85 
 
 
389 aa  295  8e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265053  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  45.19 
 
 
391 aa  294  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  42.2 
 
 
374 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  44.39 
 
 
391 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  45 
 
 
375 aa  289  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0237  acetylornithine deacetylase  44.03 
 
 
387 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7452  acetylornithine deacetylase (ArgE)  44.57 
 
 
397 aa  286  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248803  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1880  acetylornithine deacetylase  44.03 
 
 
387 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  40.85 
 
 
376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  44.35 
 
 
391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  42.47 
 
 
374 aa  281  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  41.49 
 
 
392 aa  280  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1579  acetylornithine deacetylase  43.73 
 
 
387 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.669783 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  41.6 
 
 
374 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4939  acetylornithine deacetylase  44.24 
 
 
424 aa  277  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  44.17 
 
 
389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  42.29 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0717  acetylornithine deacetylase  39.53 
 
 
388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150361  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2313  acetylornithine deacetylase (ArgE)  42.6 
 
 
389 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2582  acetylornithine deacetylase (ArgE)  43.72 
 
 
397 aa  263  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5029  acetylornithine deacetylase  43.55 
 
 
373 aa  256  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  40.64 
 
 
389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  34.51 
 
 
381 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  33.59 
 
 
391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  36.57 
 
 
383 aa  192  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0603  acetylornithine deacetylase (ArgE)  38.99 
 
 
371 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  34.7 
 
 
387 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0595  acetylornithine deacetylase (ArgE)  38.99 
 
 
371 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0568  acetylornithine deacetylase  38.99 
 
 
371 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.783579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  36.1 
 
 
381 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  35.46 
 
 
386 aa  186  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  32.64 
 
 
383 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  33.33 
 
 
383 aa  184  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  35.11 
 
 
389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>