More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0194 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  79.48 
 
 
387 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  79.79 
 
 
383 aa  663    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  80.05 
 
 
383 aa  665    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  81.89 
 
 
383 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  79.53 
 
 
383 aa  662    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  80.05 
 
 
383 aa  665    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  79.59 
 
 
389 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  79.79 
 
 
383 aa  663    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  81.63 
 
 
383 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  81.63 
 
 
383 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  92.41 
 
 
383 aa  724    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  81.89 
 
 
383 aa  672    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  81.63 
 
 
383 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  85.83 
 
 
383 aa  703    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  81.63 
 
 
383 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0194  acetylornithine deacetylase  100 
 
 
382 aa  791    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  79.79 
 
 
383 aa  660    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  79.79 
 
 
383 aa  662    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  77.63 
 
 
381 aa  640    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  79.48 
 
 
387 aa  651    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  80.05 
 
 
383 aa  664    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  85.56 
 
 
383 aa  701    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  79.79 
 
 
383 aa  663    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  60.53 
 
 
378 aa  477  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  60 
 
 
378 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  56.28 
 
 
386 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  57.14 
 
 
383 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  56.61 
 
 
383 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  56.84 
 
 
382 aa  454  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  55.56 
 
 
383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2221  acetylornithine deacetylase  57.78 
 
 
378 aa  438  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0456385  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4277  acetylornithine deacetylase  56.88 
 
 
383 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00886468  normal  0.333205 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2755  acetylornithine deacetylase  58.05 
 
 
378 aa  441  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  53.07 
 
 
381 aa  433  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  55.53 
 
 
383 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  53.17 
 
 
382 aa  411  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  49.21 
 
 
387 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  50.92 
 
 
380 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  50.79 
 
 
382 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  47.62 
 
 
391 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  49.74 
 
 
380 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  50.26 
 
 
380 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  50.13 
 
 
380 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  49.74 
 
 
382 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  49.61 
 
 
395 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  48.27 
 
 
387 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  49.1 
 
 
388 aa  361  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  46.86 
 
 
388 aa  360  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  48.68 
 
 
386 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  48.03 
 
 
388 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  46.58 
 
 
384 aa  352  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  47.24 
 
 
383 aa  349  5e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  47.77 
 
 
385 aa  345  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  42.53 
 
 
389 aa  320  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1225  peptidase dimerization domain protein  41.94 
 
 
261 aa  193  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  32.9 
 
 
379 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  36.09 
 
 
386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  36.09 
 
 
386 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  35.81 
 
 
391 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  35.01 
 
 
428 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  36.09 
 
 
386 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  33.25 
 
 
390 aa  186  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  34.78 
 
 
412 aa  186  8e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  34.21 
 
 
416 aa  182  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  34.72 
 
 
385 aa  182  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  31.32 
 
 
376 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  34.4 
 
 
404 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  34.86 
 
 
397 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  32.72 
 
 
389 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.02 
 
 
389 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  33.07 
 
 
374 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  33.33 
 
 
388 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  35.45 
 
 
391 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  30.87 
 
 
374 aa  176  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.75 
 
 
391 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  34.26 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  34.15 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  34.04 
 
 
411 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  35.4 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.25 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.75 
 
 
391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  33.24 
 
 
387 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  33.33 
 
 
375 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.34 
 
 
392 aa  172  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  34.85 
 
 
386 aa  172  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  32.52 
 
 
387 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.3 
 
 
393 aa  172  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  31.9 
 
 
376 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  35.09 
 
 
397 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  32.61 
 
 
390 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  30.81 
 
 
392 aa  169  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  34.19 
 
 
387 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  32.53 
 
 
404 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  32.2 
 
 
403 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  32.52 
 
 
387 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  32.93 
 
 
405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  32.93 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  32.93 
 
 
405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  32.93 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.73 
 
 
400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>