160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03479 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03479  probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  100 
 
 
468 aa  967    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1679  peptidase M28  80.22 
 
 
459 aa  752    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1646  peptidase M28  67.84 
 
 
456 aa  650    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.645217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3859  peptidase M28  63.43 
 
 
478 aa  586  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1875  peptidase M28  61.57 
 
 
509 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3608  peptidase M28  60.53 
 
 
472 aa  550  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10643  Probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  60.68 
 
 
450 aa  546  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1949  peptidase M28  47.61 
 
 
439 aa  391  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  47.39 
 
 
455 aa  355  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  41.1 
 
 
526 aa  332  6e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6133  peptidase M28  37.04 
 
 
461 aa  294  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  26.93 
 
 
677 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  31.67 
 
 
501 aa  73.6  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  31.8 
 
 
483 aa  70.1  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  29.31 
 
 
306 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  29.31 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  28.93 
 
 
537 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  29.67 
 
 
417 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  29.67 
 
 
417 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  29.67 
 
 
417 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  29.67 
 
 
417 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  29.12 
 
 
417 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  29.67 
 
 
417 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  23.76 
 
 
568 aa  60.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  47.22 
 
 
625 aa  60.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  24.82 
 
 
401 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  28.44 
 
 
541 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  28.44 
 
 
541 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  24.74 
 
 
591 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  39.36 
 
 
391 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  33.33 
 
 
434 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  24.47 
 
 
401 aa  58.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  28.64 
 
 
540 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  25.97 
 
 
325 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  39.78 
 
 
598 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  24.69 
 
 
322 aa  57.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  31.37 
 
 
397 aa  57.4  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  26.62 
 
 
506 aa  57  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  26.76 
 
 
408 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  27.62 
 
 
408 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  27.62 
 
 
408 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  27.62 
 
 
384 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  27.62 
 
 
384 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  27.62 
 
 
384 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  35.51 
 
 
450 aa  57  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  27.62 
 
 
384 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  28.3 
 
 
541 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  28.17 
 
 
532 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  27.07 
 
 
408 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  38.2 
 
 
584 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  28.17 
 
 
540 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  24.46 
 
 
305 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  28.17 
 
 
540 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  32.02 
 
 
301 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  33.61 
 
 
515 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  37.35 
 
 
420 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  33.33 
 
 
424 aa  53.9  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  30.08 
 
 
502 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  25.12 
 
 
318 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  30.07 
 
 
397 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  36.84 
 
 
555 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  34.11 
 
 
436 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  36.26 
 
 
338 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  27.23 
 
 
532 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  23.73 
 
 
504 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  31.08 
 
 
346 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  29.91 
 
 
394 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  25.48 
 
 
528 aa  51.2  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  28.64 
 
 
575 aa  51.2  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  36.99 
 
 
476 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  33.9 
 
 
550 aa  50.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  28.33 
 
 
523 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  36.17 
 
 
342 aa  50.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  36.71 
 
 
347 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  37.33 
 
 
571 aa  50.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  32.04 
 
 
308 aa  50.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  28.31 
 
 
309 aa  50.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  35.51 
 
 
522 aa  50.1  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  35.45 
 
 
535 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  36.45 
 
 
557 aa  50.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  33.64 
 
 
466 aa  50.1  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  40.85 
 
 
775 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  36.45 
 
 
557 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  36.45 
 
 
557 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  35.45 
 
 
536 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  26.58 
 
 
497 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  38.89 
 
 
556 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  34.38 
 
 
518 aa  49.3  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  34.82 
 
 
526 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  29.51 
 
 
546 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  26.27 
 
 
334 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  43.08 
 
 
539 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  33.71 
 
 
533 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  37.5 
 
 
512 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  27.69 
 
 
743 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  27.08 
 
 
529 aa  48.5  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  37.04 
 
 
557 aa  48.5  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  39.33 
 
 
524 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  35.35 
 
 
457 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  27.19 
 
 
313 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>