188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1949 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1949  peptidase M28  100 
 
 
439 aa  879    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03479  probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  47.61 
 
 
468 aa  391  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1875  peptidase M28  47.94 
 
 
509 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1679  peptidase M28  45.11 
 
 
459 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3859  peptidase M28  47.56 
 
 
478 aa  365  1e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1646  peptidase M28  46.9 
 
 
456 aa  355  6.999999999999999e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.645217 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10643  Probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  44.09 
 
 
450 aa  349  6e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3608  peptidase M28  45.83 
 
 
472 aa  343  5e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  43.1 
 
 
526 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6133  peptidase M28  41.43 
 
 
461 aa  306  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  42.24 
 
 
455 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  24.65 
 
 
591 aa  70.1  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  24.47 
 
 
568 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  40 
 
 
501 aa  63.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  27.44 
 
 
338 aa  62.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  28.51 
 
 
306 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  38.53 
 
 
677 aa  59.7  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  22.26 
 
 
476 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  23.35 
 
 
430 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  28.51 
 
 
306 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  30.72 
 
 
397 aa  56.6  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07035  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04210)  28.57 
 
 
390 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  36.09 
 
 
483 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  33.33 
 
 
424 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  27.23 
 
 
333 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  25.81 
 
 
334 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  32.76 
 
 
497 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  27.18 
 
 
531 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  34.82 
 
 
391 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  36.46 
 
 
534 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  24.62 
 
 
491 aa  54.7  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  34.69 
 
 
526 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  28.99 
 
 
346 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  29.24 
 
 
417 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  29.24 
 
 
417 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  29.24 
 
 
417 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  23.49 
 
 
528 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  34.62 
 
 
417 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  29.82 
 
 
417 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  26.77 
 
 
436 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  25.61 
 
 
537 aa  54.3  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  37.37 
 
 
450 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  37 
 
 
525 aa  53.9  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  36.54 
 
 
417 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  40 
 
 
408 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  38.82 
 
 
408 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  31.13 
 
 
625 aa  53.5  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  38.82 
 
 
384 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  38.82 
 
 
384 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  38.82 
 
 
384 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  38.82 
 
 
384 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  38.82 
 
 
408 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  36.21 
 
 
536 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  36.21 
 
 
535 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  29.41 
 
 
397 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  27.92 
 
 
539 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  25.58 
 
 
504 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  36.45 
 
 
512 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  30.09 
 
 
325 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  33.33 
 
 
401 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  31.9 
 
 
401 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  33.94 
 
 
512 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  37.65 
 
 
408 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  38.46 
 
 
549 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28372  leucyl aminopeptidase precursor  27.14 
 
 
407 aa  52  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.36652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  35.96 
 
 
546 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  28.5 
 
 
523 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  35.19 
 
 
513 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  30.71 
 
 
515 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  37.5 
 
 
551 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  34.26 
 
 
512 aa  50.8  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  23.27 
 
 
533 aa  50.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  28.42 
 
 
584 aa  50.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  37.38 
 
 
548 aa  50.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  36.17 
 
 
518 aa  50.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  31.43 
 
 
466 aa  50.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  30.43 
 
 
506 aa  50.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  29.13 
 
 
420 aa  50.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  29.93 
 
 
466 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  24.46 
 
 
305 aa  49.7  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  34.48 
 
 
481 aa  50.1  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  26.32 
 
 
574 aa  50.1  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  37.97 
 
 
465 aa  50.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  37.5 
 
 
545 aa  50.1  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  37.08 
 
 
549 aa  50.1  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  27.03 
 
 
394 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17180  predicted aminopeptidase  33.65 
 
 
747 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00826733  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  32.29 
 
 
422 aa  49.7  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  37.5 
 
 
533 aa  49.7  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  28.68 
 
 
462 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  26.28 
 
 
323 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  34.81 
 
 
563 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  38.2 
 
 
575 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  41.43 
 
 
598 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  29.57 
 
 
541 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  29.57 
 
 
541 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  29.57 
 
 
541 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  30.43 
 
 
540 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  37.97 
 
 
466 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  42.65 
 
 
502 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0943032 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>