More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13850 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  882    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  62.47 
 
 		 451 aa  527  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  59.5 
 
 		 446 aa  508  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  57.6 
 
 		 434 aa  505  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  58.29 
 
 		 434 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  58.29 
 
 		 441 aa  498  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  60.6 
 
 		 442 aa  496  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  58.29 
 
 		 441 aa  483  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  57.08 
 
 		 438 aa  478  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  56.91 
 
 		 445 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  54.04 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  53.46 
 
 		 432 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  51.83 
 
 		 439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  52.87 
 
 		 440 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  53.1 
 
 		 442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  52.41 
 
 		 442 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  54.23 
 
 		 444 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  52.44 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  53.09 
 
 		 440 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  52.28 
 
 		 434 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  53 
 
 		 452 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  53.23 
 
 		 462 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  53 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  52.48 
 
 		 443 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  51.25 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  51.03 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  52.3 
 
 		 439 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  52.18 
 
 		 442 aa  418  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  50.12 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  51.82 
 
 		 451 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  51.26 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  51.03 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  51.26 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  51.27 
 
 		 430 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  48.64 
 
 		 446 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  47.93 
 
 		 421 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  46.22 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  49.3 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  48.97 
 
 		 448 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  45.62 
 
 		 468 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  47.7 
 
 		 428 aa  359  7e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  47.06 
 
 		 468 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  31.65 
 
 		 434 aa  169  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  30.31 
 
 		 485 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  29.93 
 
 		 473 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  28.64 
 
 		 469 aa  162  9e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  28.89 
 
 		 468 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  29.08 
 
 		 478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  30.49 
 
 		 477 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  30.92 
 
 		 494 aa  146  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  31.71 
 
 		 489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  30.03 
 
 		 457 aa  139  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  29.85 
 
 		 497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  29.74 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  27.37 
 
 		 472 aa  133  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  28.12 
 
 		 508 aa  132  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  25.71 
 
 		 477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  30.25 
 
 		 507 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  30.25 
 
 		 507 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  27.19 
 
 		 476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  26.43 
 
 		 493 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  28.08 
 
 		 465 aa  122  9e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  29.24 
 
 		 510 aa  120  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  27.84 
 
 		 493 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.77 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.4 
 
 		 388 aa  117  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  29.97 
 
 		 549 aa  116  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  28.2 
 
 		 491 aa  116  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  26.48 
 
 		 493 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  28.05 
 
 		 494 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  27.68 
 
 		 493 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  25.88 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  27.53 
 
 		 440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  26.62 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  29.2 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.21 
 
 		 433 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  26.33 
 
 		 487 aa  104  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  33.06 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  28.61 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  26.13 
 
 		 490 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  26.85 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.7 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  29.4 
 
 		 373 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  26.32 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  28.51 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  28.82 
 
 		 415 aa  89.7  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  27.51 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.51 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.49 
 
 		 395 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  24.93 
 
 		 407 aa  88.2  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.65 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  27.48 
 
 		 374 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  27.95 
 
 		 415 aa  87.4  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  25.06 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  28.37 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  30.09 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  31.64 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  23.45 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  26.82 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  23.37 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>