More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0248 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  971    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  48.05 
 
 		 478 aa  428  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  48.51 
 
 		 485 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  42.4 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  43.44 
 
 		 472 aa  364  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  42.79 
 
 		 476 aa  347  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  35.59 
 
 		 468 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  36.87 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  33.26 
 
 		 467 aa  240  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  29.56 
 
 		 473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  31.68 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  31.65 
 
 		 443 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  31.15 
 
 		 442 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  30.53 
 
 		 449 aa  172  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  28.35 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  30.4 
 
 		 448 aa  170  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  29.47 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  30.73 
 
 		 430 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  30.89 
 
 		 446 aa  166  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  30.05 
 
 		 433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  28.95 
 
 		 434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  30 
 
 		 439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  30.9 
 
 		 451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  28.41 
 
 		 452 aa  163  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  29.21 
 
 		 438 aa  163  7e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  28.64 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  28.51 
 
 		 462 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  30.15 
 
 		 441 aa  160  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  29.76 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  28.12 
 
 		 434 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  28.71 
 
 		 450 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  29.61 
 
 		 444 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  29.61 
 
 		 444 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  28.81 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  29.61 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  29.16 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  30.75 
 
 		 442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  28.49 
 
 		 421 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  29.43 
 
 		 468 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  29.29 
 
 		 491 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  29.71 
 
 		 440 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  29.79 
 
 		 435 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  25.81 
 
 		 485 aa  150  5e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  29.27 
 
 		 439 aa  150  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  29.32 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  29.87 
 
 		 442 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  28.06 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  28.91 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  28.03 
 
 		 468 aa  143  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  27.15 
 
 		 428 aa  143  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  26.98 
 
 		 440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  28.35 
 
 		 549 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  27.37 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  29.29 
 
 		 429 aa  141  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  28.61 
 
 		 493 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  29.4 
 
 		 510 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  27.81 
 
 		 497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  25.58 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  29.97 
 
 		 445 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  28.09 
 
 		 493 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  29.77 
 
 		 507 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  29.77 
 
 		 507 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  27.43 
 
 		 508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  28.03 
 
 		 493 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  29.41 
 
 		 487 aa  131  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  27.05 
 
 		 489 aa  129  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  26.84 
 
 		 494 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  25.45 
 
 		 477 aa  126  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  25.87 
 
 		 493 aa  123  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  27.7 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  26.85 
 
 		 483 aa  113  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  27.86 
 
 		 490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  26.94 
 
 		 477 aa  106  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.33 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  27.97 
 
 		 465 aa  97.8  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  36.16 
 
 		 368 aa  91.3  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10986  conserved hypothetical protein  23.7 
 
 		 564 aa  90.1  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34371  Gly-X carboxypeptidase  24.42 
 
 		 582 aa  87  7e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02910  Gly-X carboxypeptidase, putative  27.03 
 
 		 573 aa  83.6  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.29 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.29 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04480  carboxypeptidase s precursor, putative  28.29 
 
 		 587 aa  81.3  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0506615  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.11 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  28.52 
 
 		 591 aa  78.6  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  24.6 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  23.26 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.53 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.0448181 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.52 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.765563  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  22.41 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1192  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.29 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.467708  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.6 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  24 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  24.51 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  35.25 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  23.18 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.53 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.09 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  25.95 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  34.06 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0688  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.29 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>