More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2162 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  90.55 
 
 
434 aa  812    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  882    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  68.36 
 
 
441 aa  594  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  66.67 
 
 
438 aa  588  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  67.21 
 
 
445 aa  585  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  68.14 
 
 
442 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  65.35 
 
 
446 aa  577  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  61.03 
 
 
441 aa  536  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  60.47 
 
 
434 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  60.09 
 
 
439 aa  529  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  58.56 
 
 
435 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  58.1 
 
 
432 aa  508  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  59.15 
 
 
440 aa  508  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  58.29 
 
 
437 aa  507  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  57.28 
 
 
440 aa  501  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  56.48 
 
 
442 aa  499  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  55.81 
 
 
442 aa  498  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  56.57 
 
 
433 aa  489  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  57.28 
 
 
462 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  55.84 
 
 
443 aa  490  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  56.81 
 
 
452 aa  488  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  56.94 
 
 
429 aa  485  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  55.4 
 
 
444 aa  487  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  56.71 
 
 
443 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  56.88 
 
 
442 aa  483  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  55.17 
 
 
451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  55.27 
 
 
439 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  56.14 
 
 
444 aa  455  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  52.01 
 
 
449 aa  449  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  54.46 
 
 
444 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  54.46 
 
 
444 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  54.46 
 
 
444 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  54 
 
 
451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  53.52 
 
 
430 aa  433  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  51.49 
 
 
450 aa  430  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  51.25 
 
 
448 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  50 
 
 
421 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  47.85 
 
 
446 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  49.77 
 
 
428 aa  395  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  46.98 
 
 
434 aa  391  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  45.65 
 
 
468 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  46.49 
 
 
468 aa  361  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  31.86 
 
 
434 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.85 
 
 
477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  32.67 
 
 
473 aa  183  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  29.38 
 
 
478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  31.01 
 
 
485 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  30.82 
 
 
494 aa  162  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  28.12 
 
 
469 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  30.1 
 
 
467 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  29.8 
 
 
472 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  27.15 
 
 
468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  32.52 
 
 
497 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  30.58 
 
 
508 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  28.92 
 
 
457 aa  133  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  27.84 
 
 
485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  28.39 
 
 
487 aa  126  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.01 
 
 
413 aa  125  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.16 
 
 
433 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  25.91 
 
 
476 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  30.88 
 
 
419 aa  119  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  28.46 
 
 
549 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  27.57 
 
 
489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  28.34 
 
 
493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  26.51 
 
 
490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  26.25 
 
 
477 aa  111  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  27.39 
 
 
493 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  28.43 
 
 
493 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  28.32 
 
 
510 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.74 
 
 
393 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.83 
 
 
388 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  26.34 
 
 
395 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  25.71 
 
 
491 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  27.88 
 
 
374 aa  103  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  28.42 
 
 
440 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  26.45 
 
 
465 aa  101  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  26.27 
 
 
390 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  27.39 
 
 
507 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  30.22 
 
 
373 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  27.39 
 
 
507 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  26.98 
 
 
368 aa  96.3  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  27.01 
 
 
494 aa  96.3  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  28.98 
 
 
396 aa  95.5  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  26.87 
 
 
493 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  27.86 
 
 
399 aa  93.2  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  29.79 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  22.86 
 
 
391 aa  92.8  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  26.27 
 
 
415 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  26.42 
 
 
415 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  29.55 
 
 
407 aa  90.5  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  26.46 
 
 
421 aa  90.1  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  26.42 
 
 
415 aa  89.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01640  conserved hypothetical protein  25.13 
 
 
660 aa  88.6  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  30.25 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06270  carboxypeptidase s precursor, putative  26.99 
 
 
602 aa  88.2  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  33.33 
 
 
413 aa  87.4  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  31.51 
 
 
357 aa  87  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.34 
 
 
395 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  27.24 
 
 
415 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  25.78 
 
 
591 aa  85.5  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>