More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2128 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  100 
 
 
446 aa  908    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  71.95 
 
 
444 aa  653    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  75.85 
 
 
448 aa  701    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  71.95 
 
 
444 aa  654    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  74.31 
 
 
451 aa  659    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  69.2 
 
 
450 aa  642    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  71.95 
 
 
444 aa  654    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  73.02 
 
 
430 aa  641    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  65.06 
 
 
439 aa  577  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  63.64 
 
 
443 aa  565  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  59.17 
 
 
442 aa  507  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  56.35 
 
 
442 aa  502  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  56.01 
 
 
442 aa  500  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  55.58 
 
 
449 aa  491  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  57.27 
 
 
443 aa  489  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  56.95 
 
 
452 aa  487  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  56.71 
 
 
440 aa  480  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  55.02 
 
 
462 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  53.76 
 
 
435 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  54.52 
 
 
432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  55.79 
 
 
433 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  57.11 
 
 
440 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  55.4 
 
 
434 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  51.72 
 
 
446 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  48.05 
 
 
434 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  47.85 
 
 
434 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  51.73 
 
 
444 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  49.77 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  51.58 
 
 
442 aa  411  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  48.98 
 
 
438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  49.89 
 
 
441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  49.66 
 
 
445 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  46.91 
 
 
439 aa  400  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  49.88 
 
 
451 aa  397  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  48.64 
 
 
437 aa  386  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  45.98 
 
 
434 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  50 
 
 
444 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  44.8 
 
 
441 aa  364  2e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  46.56 
 
 
421 aa  362  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  45.5 
 
 
428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  42.73 
 
 
468 aa  337  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  40.45 
 
 
468 aa  311  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  31.63 
 
 
478 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  30.86 
 
 
434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  30.89 
 
 
469 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  29.77 
 
 
485 aa  159  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.41 
 
 
477 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  30 
 
 
473 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  27.84 
 
 
494 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  33.33 
 
 
497 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  29.69 
 
 
467 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  28.09 
 
 
493 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  29.61 
 
 
472 aa  139  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  29.43 
 
 
549 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  28.72 
 
 
468 aa  136  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  30.73 
 
 
489 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  26.89 
 
 
493 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  26.86 
 
 
457 aa  127  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  28.72 
 
 
487 aa  127  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  26.79 
 
 
476 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  27.43 
 
 
508 aa  124  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  29.07 
 
 
491 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  26.91 
 
 
493 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  27.13 
 
 
485 aa  120  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.31 
 
 
388 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  28.29 
 
 
510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  29.26 
 
 
494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  27.78 
 
 
493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  26.41 
 
 
507 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  26.41 
 
 
507 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  26.24 
 
 
374 aa  108  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  27.15 
 
 
477 aa  107  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.19 
 
 
413 aa  106  9e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  28.74 
 
 
421 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  25.19 
 
 
490 aa  99.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  27.3 
 
 
465 aa  96.3  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  24.08 
 
 
390 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.81 
 
 
433 aa  91.3  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  25.13 
 
 
483 aa  91.3  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.64 
 
 
395 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.14 
 
 
393 aa  90.5  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  25.06 
 
 
395 aa  89.7  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  27.29 
 
 
419 aa  89.7  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  32.42 
 
 
409 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  23.66 
 
 
391 aa  87  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.89 
 
 
396 aa  87  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  24.81 
 
 
440 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  25 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  26.76 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  30.8 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  30.04 
 
 
396 aa  84  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  30.3 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  25.75 
 
 
397 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  26.11 
 
 
410 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04810  vacuolar carboxypeptidase Cps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07040)  26.37 
 
 
581 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0953418  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  25.25 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1333  diaminopimelate aminotransferase  27.07 
 
 
407 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  26.15 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.51 
 
 
433 aa  81.3  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  31.91 
 
 
384 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>