More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1810 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 410 aa  837    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  62.09 
 
 		 409 aa  511  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1333  diaminopimelate aminotransferase  58.85 
 
 		 407 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  55.86 
 
 		 406 aa  462  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  50.5 
 
 		 409 aa  426  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  50.49 
 
 		 413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  47.75 
 
 		 411 aa  386  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  42.75 
 
 		 411 aa  377  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  42.54 
 
 		 413 aa  348  9e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  40.25 
 
 		 407 aa  345  1e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.91 
 
 		 404 aa  318  1e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  36.54 
 
 		 407 aa  315  8e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  42.31 
 
 		 396 aa  311  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  41.9 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  41.03 
 
 		 411 aa  290  3e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  40.73 
 
 		 421 aa  286  4e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  36.83 
 
 		 415 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  37.02 
 
 		 415 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  36.3 
 
 		 415 aa  272  6e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  36.63 
 
 		 415 aa  269  5e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  34.61 
 
 		 423 aa  269  8e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.1 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  27.53 
 
 		 440 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.76 
 
 		 398 aa  99.8  8e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.49 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  28.79 
 
 		 442 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  28.47 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  27.18 
 
 		 442 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  27.49 
 
 		 439 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  27.3 
 
 		 433 aa  97.4  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  26.63 
 
 		 462 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  22.66 
 
 		 422 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  26.17 
 
 		 442 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  31.08 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  26.72 
 
 		 452 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  23.72 
 
 		 422 aa  94.4  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.84 
 
 		 423 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  25.98 
 
 		 443 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.12 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  26.87 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.19 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  31.8 
 
 		 434 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  28.28 
 
 		 374 aa  90.1  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  30.96 
 
 		 439 aa  90.1  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.36 
 
 		 423 aa  89.7  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  27.93 
 
 		 441 aa  89.7  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  28.96 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.28 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.65 
 
 		 419 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.53 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  31.42 
 
 		 451 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.53 
 
 		 423 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  30.25 
 
 		 434 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  25.19 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  27.81 
 
 		 450 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.07 
 
 		 433 aa  87.8  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  32.99 
 
 		 430 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.42 
 
 		 411 aa  87.4  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.65 
 
 		 419 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.65 
 
 		 419 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  28.09 
 
 		 419 aa  87  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  21.7 
 
 		 382 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  30 
 
 		 445 aa  86.7  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  26.47 
 
 		 435 aa  86.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  22.33 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  24.88 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  27.73 
 
 		 374 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  26.72 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.74 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  26.12 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  27.82 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  25.45 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  31.56 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  31.56 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  30.09 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  31.56 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  22.33 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  22.33 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3737  acetylornithine deacetylase  33.14 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.11 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  22.57 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  27.93 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  31.9 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  25.93 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0847  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.97 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359888  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  22.09 
 
 		 422 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  22.09 
 
 		 422 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  22.09 
 
 		 422 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  26.11 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  31.94 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.21 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  26.16 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  25.79 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.47 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  26.12 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  22.09 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2875  acetylornithine deacetylase  32.35 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0354  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.81 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.57 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>