More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2654 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  71.3 
 
 		 442 aa  650    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  70.68 
 
 		 442 aa  650    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  100 
 
 		 443 aa  898    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  63.86 
 
 		 442 aa  571  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  66.28 
 
 		 452 aa  570  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  65.49 
 
 		 435 aa  567  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  65.06 
 
 		 462 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  63.66 
 
 		 443 aa  558  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  63.57 
 
 		 440 aa  543  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  62.01 
 
 		 432 aa  543  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  60.94 
 
 		 440 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  60.84 
 
 		 433 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  62.94 
 
 		 439 aa  537  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  58.7 
 
 		 434 aa  518  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  60.77 
 
 		 442 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  59.12 
 
 		 438 aa  514  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  57.27 
 
 		 446 aa  504  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  60.14 
 
 		 451 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  59.32 
 
 		 444 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  56.67 
 
 		 450 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  56.07 
 
 		 434 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  60.41 
 
 		 444 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  60.41 
 
 		 444 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  60.41 
 
 		 444 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  57.89 
 
 		 445 aa  494  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  59.72 
 
 		 430 aa  491  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  57.11 
 
 		 429 aa  489  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  55.61 
 
 		 448 aa  488  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  57.18 
 
 		 446 aa  486  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  55.68 
 
 		 441 aa  486  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  53.74 
 
 		 434 aa  484  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  55.08 
 
 		 449 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  59.47 
 
 		 444 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  54.93 
 
 		 441 aa  464  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  51.49 
 
 		 439 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  51.26 
 
 		 437 aa  433  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  51.16 
 
 		 421 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  52.45 
 
 		 428 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  49.2 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  49.42 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  47.3 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  43.82 
 
 		 468 aa  361  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  31.84 
 
 		 473 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  31.65 
 
 		 469 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  30.44 
 
 		 434 aa  166  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  30 
 
 		 485 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  29.08 
 
 		 478 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  29.46 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  32.88 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  30.69 
 
 		 467 aa  156  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  30.05 
 
 		 494 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  27.42 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  31.62 
 
 		 497 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  28.54 
 
 		 457 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  27.31 
 
 		 485 aa  133  6e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  29.11 
 
 		 489 aa  133  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  26.85 
 
 		 476 aa  133  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  27.53 
 
 		 508 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  27.81 
 
 		 549 aa  127  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  27.76 
 
 		 487 aa  126  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  27.76 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  27.92 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  24.03 
 
 		 477 aa  117  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  28.22 
 
 		 507 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  28.22 
 
 		 507 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  27.44 
 
 		 465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  26.88 
 
 		 493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.88 
 
 		 413 aa  113  6e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  28.29 
 
 		 493 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  27.16 
 
 		 510 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  25.43 
 
 		 493 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  26.56 
 
 		 390 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  26.34 
 
 		 493 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  25.47 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.38 
 
 		 433 aa  103  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  27.82 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.29 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  31.38 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  28.29 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  28.03 
 
 		 419 aa  96.3  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  26.91 
 
 		 494 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.53 
 
 		 395 aa  94  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  25.98 
 
 		 410 aa  93.6  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  28.04 
 
 		 396 aa  93.2  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  26.67 
 
 		 413 aa  93.2  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  27.82 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.75 
 
 		 393 aa  91.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  25.5 
 
 		 483 aa  90.9  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  26.89 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  23.81 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  26.86 
 
 		 406 aa  87  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04810  vacuolar carboxypeptidase Cps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07040)  28.92 
 
 		 581 aa  86.7  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0953418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.25 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  25.37 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  27.45 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  26.19 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.87 
 
 		 400 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  29.04 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  27.32 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  24.09 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>