More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8178 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  100 
 
 		 373 aa  744    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.5 
 
 		 395 aa  293  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  44.95 
 
 		 380 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  48.92 
 
 		 357 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  44.17 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  44.17 
 
 		 364 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  29.63 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.29 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.92 
 
 		 381 aa  152  7e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  33.77 
 
 		 397 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0076  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.2 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  32.98 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2475  acetylornithine deacetylase  33.33 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0713768  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  35.24 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2796  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.36 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.884075 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  34.71 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  36.02 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  36.02 
 
 		 405 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  36.02 
 
 		 405 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  36.02 
 
 		 405 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  36.02 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  36.02 
 
 		 405 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  36.02 
 
 		 586 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  34.22 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  31.67 
 
 		 391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.99 
 
 		 393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.49 
 
 		 400 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.59 
 
 		 398 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  36.77 
 
 		 388 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  31.78 
 
 		 406 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  33.66 
 
 		 406 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  33.66 
 
 		 406 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  33.66 
 
 		 406 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  31.46 
 
 		 406 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  33 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.18 
 
 		 396 aa  136  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  33 
 
 		 406 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.53 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.38 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  26.79 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  32.67 
 
 		 388 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  31.54 
 
 		 389 aa  134  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  30.91 
 
 		 412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  32.44 
 
 		 411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  34.07 
 
 		 373 aa  133  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  30.12 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  31.63 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2318  peptidase M20  34.32 
 
 		 449 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00838569  decreased coverage  0.00000161577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  29.13 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.67 
 
 		 413 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  30.65 
 
 		 404 aa  129  9.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  31.18 
 
 		 387 aa  129  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.98 
 
 		 422 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.47 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  26.26 
 
 		 384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  33.54 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  32.25 
 
 		 378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  28.68 
 
 		 385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  29.56 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  32.42 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  29.56 
 
 		 383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  28.01 
 
 		 385 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  29.28 
 
 		 383 aa  126  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  32.02 
 
 		 416 aa  126  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  28.66 
 
 		 419 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  29.28 
 
 		 383 aa  125  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.28 
 
 		 383 aa  125  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  29.28 
 
 		 383 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  29.28 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  29.28 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  32.97 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  29.28 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  31.97 
 
 		 434 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  33.25 
 
 		 377 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  30.62 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.05 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7943  hypothetical protein  77.5 
 
 		 87 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  34.24 
 
 		 424 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  31.95 
 
 		 393 aa  123  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  28.3 
 
 		 382 aa  123  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  31.65 
 
 		 395 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  29.49 
 
 		 383 aa  123  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  27.44 
 
 		 398 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.32 
 
 		 392 aa  122  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.63 
 
 		 391 aa  122  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  30.35 
 
 		 383 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  30.35 
 
 		 383 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  29.97 
 
 		 379 aa  122  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  30.35 
 
 		 383 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  30.14 
 
 		 378 aa  122  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  30.35 
 
 		 383 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.15 
 
 		 398 aa  122  9e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.06 
 
 		 387 aa  122  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  31.87 
 
 		 403 aa  122  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  32.21 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.25 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.15 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5037  peptidase M20  35.14 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.357422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  31.58 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  30.87 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>