More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2580 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 357 aa  696    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  47.91 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  47.91 
 
 		 364 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  44.54 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  48.92 
 
 		 373 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.72 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5037  peptidase M20  42.15 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.357422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.35 
 
 		 381 aa  161  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  35.49 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  33.8 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  29.1 
 
 		 384 aa  149  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  29.63 
 
 		 384 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  32.48 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  29.79 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.22 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.41 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  33.33 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  29.7 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  30.68 
 
 		 374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  34.89 
 
 		 376 aa  140  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  31.79 
 
 		 391 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  32.45 
 
 		 374 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  31.33 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  35.94 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  36.23 
 
 		 386 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  33.62 
 
 		 386 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.03 
 
 		 407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  31.99 
 
 		 403 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.03 
 
 		 407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.97 
 
 		 389 aa  136  7.000000000000001e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  33.04 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  33.52 
 
 		 388 aa  132  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  35.71 
 
 		 386 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  32.98 
 
 		 388 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.43 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  31.73 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  31.3 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  37.05 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  32.27 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  29.82 
 
 		 379 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5029  acetylornithine deacetylase  34.65 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  35.07 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  32.61 
 
 		 374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  29.01 
 
 		 378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  30.79 
 
 		 428 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  32.29 
 
 		 387 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  33.66 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.86 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  35.06 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  34.92 
 
 		 380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  34.39 
 
 		 387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  28.81 
 
 		 378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.94 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  34.6 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  33.33 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.39 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  31.97 
 
 		 404 aa  126  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  24.93 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  32.95 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  28.45 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2796  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.3 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.884075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.12 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  29.41 
 
 		 422 aa  123  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 390 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  31.43 
 
 		 386 aa  122  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  30.53 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.76 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.95 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  30.38 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  27.17 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  32.92 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.82 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  30.59 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  30.77 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  30.06 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  31.01 
 
 		 395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  35.03 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  31.59 
 
 		 383 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  33.12 
 
 		 411 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  32.47 
 
 		 406 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  32.47 
 
 		 406 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.62 
 
 		 433 aa  119  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  32.47 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  30.94 
 
 		 416 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  31.97 
 
 		 406 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  30.5 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.12 
 
 		 423 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  31.01 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  34.31 
 
 		 384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  32.23 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  31.66 
 
 		 406 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  32.83 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  30.86 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.69 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.12 
 
 		 439 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  29 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  31.01 
 
 		 384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4229  peptidase M20  29.72 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2582  acetylornithine deacetylase (ArgE)  37.21 
 
 		 397 aa  116  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  27.81 
 
 		 382 aa  116  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>