More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0117 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  100 
 
 		 401 aa  821    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1729  peptidase  54.34 
 
 		 400 aa  441  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0424  M20/DapE family protein YgeY  49.35 
 
 		 413 aa  411  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02705  hypothetical protein  49.48 
 
 		 403 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0820  M20/DapE family protein YgeY  49.48 
 
 		 403 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0836  peptidase  49.48 
 
 		 403 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02667  hypothetical protein  49.48 
 
 		 402 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3197  peptidase  49.74 
 
 		 403 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4162  peptidase  49.48 
 
 		 403 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3032  peptidase  49.48 
 
 		 403 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3005  peptidase  49.48 
 
 		 403 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0240  peptidase  46.06 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000787577  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  45.5 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1432  peptidase  45.88 
 
 		 445 aa  365  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2652  M20/DapE family protein YgeY  45.75 
 
 		 443 aa  364  2e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1663  M20/DapE family protein YgeY  43.22 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  32.14 
 
 		 394 aa  219  7e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0260  peptidase  34.17 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2961  peptidase  34.61 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4537  peptidase  31.89 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.468696  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1267  peptidase  33.17 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  33.42 
 
 		 394 aa  210  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0255  peptidase M20  31.54 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  24.82 
 
 		 422 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  26.34 
 
 		 422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  24.51 
 
 		 422 aa  120  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.38 
 
 		 389 aa  119  7.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  24.51 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  24.26 
 
 		 422 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.72 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  24.94 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.99 
 
 		 410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  24.08 
 
 		 422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  24.08 
 
 		 422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0233  peptidase M20  30.54 
 
 		 420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  24.08 
 
 		 422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  23.04 
 
 		 422 aa  112  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  24.35 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.46 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  23.83 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  23.9 
 
 		 422 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0144  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.69 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.131428  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.79 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  27.55 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  26.49 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  26.44 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.72 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.119075  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  26.94 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  27.2 
 
 		 383 aa  103  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  26.42 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.2 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  26.42 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  27.2 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  26.42 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  26.77 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  27.08 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0019  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.8 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.191094  hitchhiker  0.000354462 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.23 
 
 		 387 aa  101  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  25.91 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0076  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.98 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  26.68 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0025  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.42 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.67 
 
 		 435 aa  99.8  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  27.06 
 
 		 383 aa  99.8  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.92 
 
 		 405 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  25.81 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  24.35 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  24.48 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.76 
 
 		 413 aa  98.2  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.17 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  26.28 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  25.99 
 
 		 383 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  25.99 
 
 		 383 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  25.99 
 
 		 383 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.08 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  25.99 
 
 		 383 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  26.04 
 
 		 378 aa  97.8  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  24.92 
 
 		 391 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  26.75 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  26.24 
 
 		 384 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  25.99 
 
 		 383 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  26.75 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  26.75 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0847  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.15 
 
 		 413 aa  97.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0027  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  23.39 
 
 		 355 aa  97.4  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  26.46 
 
 		 381 aa  96.7  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  24.25 
 
 		 388 aa  97.1  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4522  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.51 
 
 		 428 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.55 
 
 		 407 aa  96.3  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.55 
 
 		 407 aa  96.3  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  26.69 
 
 		 422 aa  96.3  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.77 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  24.81 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  24.73 
 
 		 375 aa  95.9  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.04 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  26.45 
 
 		 384 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  24.55 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  25.76 
 
 		 378 aa  95.5  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2842  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.26 
 
 		 382 aa  95.5  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>