More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0144 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  83.95 
 
 
389 aa  675    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0144  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
381 aa  783    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.131428  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.95 
 
 
398 aa  428  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.6 
 
 
395 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4562  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.03 
 
 
388 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  45.33 
 
 
385 aa  362  8e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0628  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.7 
 
 
387 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0077  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.16 
 
 
388 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0144823 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0474  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  45.2 
 
 
404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.12 
 
 
389 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3480  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.08 
 
 
404 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7333  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.49 
 
 
384 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0809  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.53 
 
 
392 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.486671 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.86 
 
 
426 aa  329  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.250429  normal  0.531249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3620  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.87 
 
 
377 aa  328  9e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1031  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.26 
 
 
395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1021  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.3 
 
 
388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000463021 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0972  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.26 
 
 
395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1531  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.13 
 
 
371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1338  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  45.45 
 
 
390 aa  325  8.000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.76 
 
 
397 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0449  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.8 
 
 
390 aa  324  2e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.408478 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.26 
 
 
387 aa  324  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2842  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.97 
 
 
382 aa  324  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0078  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.99 
 
 
397 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3068  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.94 
 
 
389 aa  323  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.76584  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1915  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.75 
 
 
388 aa  323  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3697  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.16 
 
 
411 aa  322  6e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.891893  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.57 
 
 
379 aa  322  8e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1601  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.71 
 
 
387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0549352 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1633  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.04 
 
 
403 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.73321  normal  0.191724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.65 
 
 
363 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.872712  normal  0.304299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3149  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.59 
 
 
392 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3336  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.35 
 
 
383 aa  309  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0627884 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0549  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.67 
 
 
407 aa  308  9e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2996  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.67 
 
 
381 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.22 
 
 
395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0642  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.46 
 
 
402 aa  306  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.39661  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0561  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.15 
 
 
407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2019  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.77 
 
 
377 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489333 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.31 
 
 
377 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1852  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.68 
 
 
378 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.751172  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2789  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.15 
 
 
380 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.345284  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0581  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.24 
 
 
375 aa  302  8.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680439  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0389  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.85 
 
 
395 aa  300  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45697  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1804  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.95 
 
 
386 aa  300  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0689482  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.84 
 
 
375 aa  299  5e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1128  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.89 
 
 
380 aa  298  8e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.07 
 
 
391 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4745  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.51 
 
 
410 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0048  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.78 
 
 
380 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1895  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.11 
 
 
383 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387687  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1271  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.47 
 
 
392 aa  296  6e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1869  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.71 
 
 
375 aa  295  8e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.82 
 
 
391 aa  295  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.32 
 
 
386 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.0448181 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2196  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40 
 
 
385 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2482  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.9 
 
 
389 aa  293  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0354  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40 
 
 
388 aa  293  4e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1420  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.01 
 
 
383 aa  292  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000737808  normal  0.0270135 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1291  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.24 
 
 
378 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2044  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.42 
 
 
391 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1390  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.93 
 
 
386 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.75 
 
 
380 aa  288  9e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0277  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.27 
 
 
401 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.89 
 
 
382 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.89 
 
 
382 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.37 
 
 
383 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.85 
 
 
383 aa  287  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1080  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.63 
 
 
375 aa  287  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4235  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.93 
 
 
396 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395056 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1150  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.32 
 
 
376 aa  285  7e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2607  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.4 
 
 
382 aa  285  9e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1327  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.48 
 
 
383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158007  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1459  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.85 
 
 
383 aa  283  5.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2554  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.68 
 
 
376 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0948  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.99 
 
 
377 aa  282  6.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0918  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.27 
 
 
377 aa  282  6.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2121  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.75 
 
 
381 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000264012 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1857  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.75 
 
 
381 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1912  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.75 
 
 
381 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49380  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.37 
 
 
383 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.545113  normal  0.68412 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.48 
 
 
384 aa  280  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3066  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.84 
 
 
380 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107032  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1994  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.81 
 
 
425 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1765  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.64 
 
 
377 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.803337  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1263  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.05 
 
 
386 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103689  normal  0.466202 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2192  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.21 
 
 
376 aa  280  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.73 
 
 
375 aa  279  6e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2418  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.79 
 
 
376 aa  279  8e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.508006  decreased coverage  0.00000131595 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.16 
 
 
377 aa  276  4e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2126  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.32 
 
 
376 aa  276  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2518  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.48 
 
 
382 aa  276  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00740773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4217  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.84 
 
 
383 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.89 
 
 
375 aa  275  8e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2354  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.21 
 
 
380 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.473063  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03183  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.11 
 
 
378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2123  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.48 
 
 
379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1568  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.15 
 
 
379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2071  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.15 
 
 
379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>