More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4005 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
400 aa  810    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.31 
 
 
387 aa  435  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.46 
 
 
396 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.29 
 
 
413 aa  159  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.2 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.92 
 
 
407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.92 
 
 
407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2796  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.43 
 
 
397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.884075 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  27.87 
 
 
402 aa  134  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.41 
 
 
405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0019  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.88 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.191094  hitchhiker  0.000354462 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0076  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.73 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  30.93 
 
 
380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  29.02 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.19 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  30.08 
 
 
411 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  27.5 
 
 
422 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.99 
 
 
399 aa  125  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4522  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.22 
 
 
428 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.27 
 
 
424 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  27.59 
 
 
422 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  28.02 
 
 
422 aa  123  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  28.02 
 
 
422 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  28.02 
 
 
422 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  28.02 
 
 
422 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.54 
 
 
398 aa  122  8e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  27.14 
 
 
422 aa  122  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  27.73 
 
 
422 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  27.73 
 
 
422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  27.43 
 
 
422 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  26.51 
 
 
422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.62 
 
 
399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  26.95 
 
 
409 aa  119  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  26.47 
 
 
422 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  28.36 
 
 
446 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.97 
 
 
409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  24.74 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.35 
 
 
388 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  28.3 
 
 
753 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.56 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  28.15 
 
 
385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  30.21 
 
 
364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.6 
 
 
407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.23 
 
 
389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  24.19 
 
 
394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  27.07 
 
 
374 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1722  acetylornithine deacetylase  25.18 
 
 
433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.633386  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  28.15 
 
 
385 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2048  acetylornithine deacetylase  25.51 
 
 
418 aa  113  7.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  26.56 
 
 
383 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  29.95 
 
 
364 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0810  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.23 
 
 
447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2961  peptidase  24.87 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  29.15 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.07 
 
 
423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.79 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  27.14 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 
412 aa  111  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.65 
 
 
423 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  29.32 
 
 
416 aa  111  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  27.76 
 
 
386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.37 
 
 
414 aa  109  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.54 
 
 
419 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.54 
 
 
419 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3755  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.48 
 
 
431 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0601129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0411  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.87 
 
 
437 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2318  peptidase M20  30 
 
 
449 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00838569  decreased coverage  0.00000161577 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  25.9 
 
 
383 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  24.46 
 
 
384 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.19 
 
 
381 aa  106  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  28.97 
 
 
422 aa  106  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  24.29 
 
 
391 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.05 
 
 
417 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  24.73 
 
 
384 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2506  acetylornithine deacetylase  28.78 
 
 
426 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183541  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  26.03 
 
 
401 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3273  hypothetical protein  27.2 
 
 
424 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425351  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3889  acetylornithine deacetylase  28.06 
 
 
426 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2664  peptidase M20  28.07 
 
 
442 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  30.69 
 
 
373 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  27.88 
 
 
428 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3442  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.56 
 
 
422 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  30.11 
 
 
373 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0792  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  29.39 
 
 
423 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.51 
 
 
393 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.8 
 
 
410 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.12 
 
 
400 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3442  acetylornithine deacetylase  29.32 
 
 
426 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.58 
 
 
388 aa  103  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  28.86 
 
 
432 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  24.43 
 
 
404 aa  103  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0233  peptidase M20  25.23 
 
 
420 aa  102  8e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571831  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  24.93 
 
 
381 aa  103  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1035  peptidase dimerisation domain protein  23.9 
 
 
424 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  27.12 
 
 
383 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12180  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  27.53 
 
 
463 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0246803  normal  0.255441 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  28.27 
 
 
394 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28 
 
 
400 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  26.34 
 
 
375 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  27.12 
 
 
400 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>