More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2506 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3442  acetylornithine deacetylase  90.14 
 
 		 426 aa  806    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2506  acetylornithine deacetylase  100 
 
 		 426 aa  881    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183541  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2352  acetylornithine deacetylase  86.49 
 
 		 424 aa  754    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.737535  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2938  acetylornithine deacetylase  92.71 
 
 		 426 aa  821    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3889  acetylornithine deacetylase  83.8 
 
 		 426 aa  756    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2875  acetylornithine deacetylase  49.52 
 
 		 427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3347  acetylornithine deacetylase  47.38 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  48.58 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3737  acetylornithine deacetylase  49.05 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1406  acetylornithine deacetylase  50.36 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.566514  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3135  acetylornithine deacetylase  47.09 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3492  acetylornithine deacetylase  47.09 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2569  acetylornithine deacetylase  46.6 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.999576  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1080  acetylornithine deacetylase  46.9 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2664  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  45.99 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.18198 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3755  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.18 
 
 		 431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0601129  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.61 
 
 		 426 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1610  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.3 
 
 		 447 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0411  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.65 
 
 		 437 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  34.29 
 
 		 446 aa  227  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4015  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  34.52 
 
 		 413 aa  223  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.07 
 
 		 429 aa  223  6e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0744  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.27 
 
 		 453 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  30.73 
 
 		 422 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.64 
 
 		 433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  31.91 
 
 		 422 aa  216  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3865  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.46 
 
 		 433 aa  212  9e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.838236  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  30.97 
 
 		 422 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  31.47 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  31.68 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  31.44 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  31.44 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  31.44 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  31.47 
 
 		 422 aa  203  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  31.21 
 
 		 422 aa  202  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  31.21 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2920  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.82 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2177  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.82 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3374  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  34.18 
 
 		 424 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0019  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.96 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.191094  hitchhiker  0.000354462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2502  acetylornithine deacetylase  31.79 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0025  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.05 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0792  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  33.89 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4522  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.26 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0097  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.44 
 
 		 437 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.75 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0810  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.18 
 
 		 447 aa  162  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12180  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  34.48 
 
 		 463 aa  162  9e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0246803  normal  0.255441 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0467  acetylornithine deacetylase  29.68 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0493  acetylornithine deacetylase  29.68 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0548  acetylornithine deacetylase  29.98 
 
 		 424 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000707223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0475  acetylornithine deacetylase  28.6 
 
 		 424 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0406  acetylornithine deacetylase  29.13 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4825  acetylornithine deacetylase  29.22 
 
 		 424 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0895557  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0410  acetylornithine deacetylase  28.38 
 
 		 424 aa  159  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0497  acetylornithine deacetylase  29.22 
 
 		 424 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00375868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0548  acetylornithine deacetylase  29.75 
 
 		 424 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0412  acetylornithine deacetylase  27.23 
 
 		 424 aa  153  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  29.3 
 
 		 417 aa  149  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  25.42 
 
 		 422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4506  acetylornithine deacetylase  31.09 
 
 		 428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0631  peptidase M20  32.05 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1499  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.54 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1722  acetylornithine deacetylase  31.41 
 
 		 433 aa  144  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.633386  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2806  peptidase M20  33.04 
 
 		 425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.58 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2048  acetylornithine deacetylase  25.87 
 
 		 418 aa  113  7.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0080  peptidase M20  26.24 
 
 		 434 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.306901  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  27.89 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  30.38 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.78 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.09 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.55 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  27.51 
 
 		 753 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1459  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.39 
 
 		 383 aa  104  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  32.88 
 
 		 389 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  33.65 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  34.68 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.07 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  32.92 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  33.78 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.86 
 
 		 397 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1869  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.8 
 
 		 375 aa  101  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.25 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0078  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.86 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  31.16 
 
 		 405 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  30.47 
 
 		 404 aa  99.8  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  34.35 
 
 		 411 aa  99.8  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  30.21 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.22 
 
 		 426 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.250429  normal  0.531249 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  30.29 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.45 
 
 		 375 aa  99.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.645839 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  30.29 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  31.22 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  30.29 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  30.29 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.74 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.33 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.0448181 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  30.21 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1390  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.43 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>