More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4285 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  100 
 
 
432 aa  888    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3135  acetylornithine deacetylase  75.81 
 
 
432 aa  694    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3492  acetylornithine deacetylase  77.91 
 
 
432 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2569  acetylornithine deacetylase  78.28 
 
 
432 aa  697    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.999576  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3442  acetylornithine deacetylase  48.11 
 
 
426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2938  acetylornithine deacetylase  49.88 
 
 
426 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2506  acetylornithine deacetylase  48.58 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183541  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2352  acetylornithine deacetylase  48.93 
 
 
424 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.737535  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3889  acetylornithine deacetylase  47.38 
 
 
426 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3347  acetylornithine deacetylase  43.06 
 
 
436 aa  360  3e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2664  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.12 
 
 
427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.18198 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1406  acetylornithine deacetylase  49.88 
 
 
427 aa  353  4e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.566514  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1080  acetylornithine deacetylase  45.41 
 
 
430 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2875  acetylornithine deacetylase  43.54 
 
 
427 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3737  acetylornithine deacetylase  43.54 
 
 
427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3755  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.76 
 
 
431 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0601129  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.07 
 
 
426 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0411  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.72 
 
 
437 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1610  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.64 
 
 
447 aa  226  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  34.52 
 
 
446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  31.13 
 
 
422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4015  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  33.98 
 
 
413 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.23 
 
 
429 aa  208  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0744  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.49 
 
 
453 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  32.08 
 
 
422 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.39 
 
 
433 aa  206  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  32.31 
 
 
422 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  30.64 
 
 
422 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  30.64 
 
 
422 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  31.62 
 
 
422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  30.64 
 
 
422 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  30.91 
 
 
422 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  30.4 
 
 
422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  30.19 
 
 
422 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  29.65 
 
 
422 aa  196  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0097  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.31 
 
 
437 aa  193  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4522  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.17 
 
 
428 aa  193  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3865  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.56 
 
 
433 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.838236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  32.71 
 
 
424 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0025  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.12 
 
 
429 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0019  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.85 
 
 
428 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.191094  hitchhiker  0.000354462 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2920  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.86 
 
 
429 aa  179  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12180  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.01 
 
 
463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0246803  normal  0.255441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3374  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  33.9 
 
 
424 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0810  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  31.75 
 
 
447 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  26.67 
 
 
417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2502  acetylornithine deacetylase  33.25 
 
 
418 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2177  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.02 
 
 
441 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0467  acetylornithine deacetylase  26.86 
 
 
426 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0493  acetylornithine deacetylase  26.86 
 
 
426 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0497  acetylornithine deacetylase  26.8 
 
 
424 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00375868  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1499  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.55 
 
 
441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0548  acetylornithine deacetylase  27.14 
 
 
424 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166552  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0792  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  34.27 
 
 
423 aa  139  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0548  acetylornithine deacetylase  26.57 
 
 
424 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000707223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0410  acetylornithine deacetylase  26.86 
 
 
424 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0475  acetylornithine deacetylase  26.86 
 
 
424 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4825  acetylornithine deacetylase  26 
 
 
424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0895557  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  26.29 
 
 
422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0406  acetylornithine deacetylase  26.57 
 
 
424 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4506  acetylornithine deacetylase  34.5 
 
 
428 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0412  acetylornithine deacetylase  25 
 
 
424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1722  acetylornithine deacetylase  28.99 
 
 
433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.633386  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0080  peptidase M20  28.18 
 
 
434 aa  126  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.306901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2048  acetylornithine deacetylase  26.87 
 
 
418 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2806  peptidase M20  29 
 
 
425 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.49 
 
 
387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0631  peptidase M20  30.79 
 
 
433 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  26.76 
 
 
393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  29.53 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  25.95 
 
 
753 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.47 
 
 
419 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.16 
 
 
407 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  26.56 
 
 
409 aa  109  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2664  peptidase M20  28.34 
 
 
442 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.06 
 
 
413 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.73 
 
 
423 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.23 
 
 
419 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.23 
 
 
419 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.4 
 
 
430 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  25.69 
 
 
402 aa  106  7e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  30.21 
 
 
411 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.86 
 
 
400 aa  103  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4390  peptidase M20  26.68 
 
 
413 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.91 
 
 
411 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0720  peptidase M20  28.97 
 
 
424 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.611917  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27 
 
 
409 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  26 
 
 
411 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.27 
 
 
383 aa  100  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.19 
 
 
410 aa  100  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1162  peptidase M20  26.62 
 
 
414 aa  100  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.988314  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0346  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.65 
 
 
447 aa  99.8  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0940118 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.19 
 
 
389 aa  99.8  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.14 
 
 
414 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.15 
 
 
388 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  29.64 
 
 
416 aa  97.1  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  27.25 
 
 
388 aa  97.1  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1459  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.26 
 
 
383 aa  97.1  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  25.38 
 
 
415 aa  96.3  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.44 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>