More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2101 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 407 aa  832    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 407 aa  832    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.1 
 
 		 405 aa  527  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.51 
 
 		 414 aa  345  8.999999999999999e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.35 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.4 
 
 		 381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  32.13 
 
 		 402 aa  196  7e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2796  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.75 
 
 		 397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.884075 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.88 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0076  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.92 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  30.59 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.89 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.22 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  26.77 
 
 		 380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.03 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  26 
 
 		 424 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  30.13 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0233  peptidase M20  26.84 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  27.96 
 
 		 382 aa  120  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  30.95 
 
 		 422 aa  119  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.43 
 
 		 396 aa  116  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  28.83 
 
 		 383 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  27.67 
 
 		 386 aa  116  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  25.92 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  25.25 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.5 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  24.11 
 
 		 364 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  25.93 
 
 		 378 aa  113  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.66 
 
 		 433 aa  113  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  27.59 
 
 		 386 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  25.93 
 
 		 378 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  27.34 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  26.7 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.94 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.250429  normal  0.531249 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  27.75 
 
 		 388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  28.3 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  26.9 
 
 		 383 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  26.9 
 
 		 383 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  26.9 
 
 		 383 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  26.9 
 
 		 383 aa  109  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  29.73 
 
 		 381 aa  109  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  27.11 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  25.43 
 
 		 387 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0078  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.06 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  29.8 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  25.86 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  26.85 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  28.61 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  24.3 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  23.25 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.35 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  27.35 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  29.18 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  29.48 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  29.43 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  26.48 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.35 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  25.46 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0474  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.21 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.82 
 
 		 399 aa  107  5e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  27.08 
 
 		 383 aa  107  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.24 
 
 		 410 aa  106  7e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  27.08 
 
 		 383 aa  106  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.28 
 
 		 431 aa  106  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  27.97 
 
 		 384 aa  106  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  27.08 
 
 		 383 aa  106  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.95 
 
 		 398 aa  106  9e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  27.72 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  29.19 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  29.19 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  29.19 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2554  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.2 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  28.28 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  28.61 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  26.29 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  25.58 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  26.41 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  28.38 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  28.38 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.49 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  28.38 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  27.45 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  24.94 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  28.9 
 
 		 422 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  25.64 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0781  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.46 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.946099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  28.9 
 
 		 422 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.46 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.438306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  27.48 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  25.55 
 
 		 390 aa  103  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  25.19 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  25.25 
 
 		 387 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  25.13 
 
 		 373 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.36 
 
 		 397 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  27.64 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  25.25 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  27.3 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  28.01 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0389  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.86 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>