More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2432 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 395 aa  803    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  48.5 
 
 		 373 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  42.9 
 
 		 380 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  45.08 
 
 		 364 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  43.84 
 
 		 364 aa  262  8e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  44.14 
 
 		 357 aa  233  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  30.05 
 
 		 402 aa  173  3.9999999999999995e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.73 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.32 
 
 		 413 aa  169  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  34.71 
 
 		 368 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.55 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.26 
 
 		 381 aa  158  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.2 
 
 		 400 aa  152  8.999999999999999e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2475  acetylornithine deacetylase  33.68 
 
 		 420 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0713768  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2318  peptidase M20  31.26 
 
 		 449 aa  146  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00838569  decreased coverage  0.00000161577 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.2 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.2 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.58 
 
 		 398 aa  143  5e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.79 
 
 		 417 aa  143  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  30.94 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.58 
 
 		 400 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.99 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  33.7 
 
 		 389 aa  137  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.97 
 
 		 400 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  29.21 
 
 		 434 aa  136  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  31.04 
 
 		 397 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  30.79 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.46 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  29.01 
 
 		 394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  29.9 
 
 		 416 aa  133  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  30.41 
 
 		 379 aa  133  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  29.16 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  29.31 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  30.55 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  30.43 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.7 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  29.87 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  32.02 
 
 		 387 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  31.62 
 
 		 386 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.41 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5037  peptidase M20  34.57 
 
 		 375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.357422  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.13 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  32.72 
 
 		 374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  29.61 
 
 		 383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2796  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.86 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.884075 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.5 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.68 
 
 		 398 aa  127  5e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  30.93 
 
 		 374 aa  126  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.05 
 
 		 399 aa  126  7e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  31.11 
 
 		 424 aa  126  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  28.18 
 
 		 390 aa  125  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0233  peptidase M20  27.43 
 
 		 420 aa  125  9e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571831  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.74 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  28.49 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  31.5 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  29.5 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  30.25 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  30.25 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  30.25 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  30.25 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  30.25 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  30.06 
 
 		 386 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  30.72 
 
 		 388 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  30.25 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  30.25 
 
 		 586 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.65 
 
 		 422 aa  123  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  29.56 
 
 		 387 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  26.94 
 
 		 381 aa  123  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  28.95 
 
 		 397 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  29.43 
 
 		 387 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.15 
 
 		 365 aa  122  8e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.119075  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  31.21 
 
 		 389 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  29.75 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  29.78 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  32.03 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  31.1 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0144  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.53 
 
 		 381 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.131428  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0990  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.06 
 
 		 365 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  31.63 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  31.04 
 
 		 386 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.97 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  30.79 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  30.83 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  30.36 
 
 		 411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  27.32 
 
 		 391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  31.02 
 
 		 396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  27.66 
 
 		 385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  27.85 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.62 
 
 		 392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0717  acetylornithine deacetylase  29.61 
 
 		 388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.65 
 
 		 366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  26.4 
 
 		 384 aa  120  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.26 
 
 		 423 aa  119  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  26.07 
 
 		 385 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2313  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.33 
 
 		 389 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0260  peptidase  27.3 
 
 		 394 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1862  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.17 
 
 		 376 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000241136 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.03 
 
 		 389 aa  119  9e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3149  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.04 
 
 		 392 aa  119  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  29.67 
 
 		 428 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>