More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2918 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  100 
 
 
389 aa  779    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  35.54 
 
 
380 aa  156  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  33.6 
 
 
389 aa  143  6e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  33.25 
 
 
386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  34.31 
 
 
376 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  32.73 
 
 
385 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  30.26 
 
 
379 aa  139  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  33.01 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  33.04 
 
 
395 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  32.45 
 
 
374 aa  137  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  31.38 
 
 
381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2601  acetylornithine deacetylase  31.87 
 
 
389 aa  136  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265053  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.42 
 
 
402 aa  135  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  30.65 
 
 
382 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  33.04 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  29.76 
 
 
412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  31.78 
 
 
374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  32.46 
 
 
388 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  30.69 
 
 
385 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  29.55 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  33.02 
 
 
411 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  30.77 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  29.95 
 
 
385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.36 
 
 
391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.37 
 
 
391 aa  130  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  32.1 
 
 
391 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  28.42 
 
 
387 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.38 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  32.1 
 
 
386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0717  acetylornithine deacetylase  32.23 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150361  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  28.97 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  32.42 
 
 
383 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  27.91 
 
 
391 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  28.97 
 
 
419 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  31.54 
 
 
373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  31.51 
 
 
384 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  31.88 
 
 
380 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  28.61 
 
 
416 aa  126  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  31.27 
 
 
376 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  33.97 
 
 
386 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  32.17 
 
 
380 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  30.51 
 
 
388 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  31.3 
 
 
380 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  31.88 
 
 
380 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.23 
 
 
392 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  31.31 
 
 
428 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  31.75 
 
 
382 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  30.69 
 
 
384 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  32.37 
 
 
386 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  32.12 
 
 
384 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.57 
 
 
442 aa  124  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  31.23 
 
 
368 aa  123  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  31.16 
 
 
385 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4939  acetylornithine deacetylase  30.64 
 
 
424 aa  123  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  33.83 
 
 
383 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  27.95 
 
 
387 aa  122  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  31.82 
 
 
397 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.55 
 
 
391 aa  122  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  31.79 
 
 
380 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  32.48 
 
 
410 aa  122  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  34.12 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.83 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  33.83 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  34.12 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  33.83 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  33.83 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  34.12 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  33.43 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  33.83 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  31.84 
 
 
375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  31.66 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  27.25 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.43 
 
 
395 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  31.02 
 
 
397 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  29.89 
 
 
416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  31.92 
 
 
387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  30.75 
 
 
389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  30.86 
 
 
405 aa  119  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  30 
 
 
386 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  28.36 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  29.64 
 
 
406 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  31.59 
 
 
388 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  32.01 
 
 
387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  28.64 
 
 
386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  30.75 
 
 
383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  31.03 
 
 
390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  29.68 
 
 
586 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  29.77 
 
 
405 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  29.77 
 
 
405 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  30.75 
 
 
383 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  29.77 
 
 
405 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  30.75 
 
 
383 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  30.75 
 
 
383 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  30.75 
 
 
383 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  29.77 
 
 
405 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  29.77 
 
 
389 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  29.77 
 
 
389 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  29.64 
 
 
406 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  31.34 
 
 
406 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  30.23 
 
 
337 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>