More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3430 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  97.8 
 
 		 364 aa  701    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  100 
 
 		 364 aa  721    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  44.84 
 
 		 380 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  47.91 
 
 		 357 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.81 
 
 		 395 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  43.48 
 
 		 373 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5037  peptidase M20  38.31 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.357422  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  37.6 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  34.15 
 
 		 397 aa  142  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.99 
 
 		 433 aa  142  8e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  31.79 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  33.71 
 
 		 388 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  32.95 
 
 		 387 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  34.29 
 
 		 386 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.47 
 
 		 381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.24 
 
 		 402 aa  135  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.95 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  32.37 
 
 		 389 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  32.35 
 
 		 388 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  27.89 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  31.89 
 
 		 386 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  31.62 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  34.03 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  33.91 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  33.23 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  30.32 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  31.58 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  32.54 
 
 		 382 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  28.39 
 
 		 392 aa  129  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.52 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.82 
 
 		 400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  30.46 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  31.94 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  33.43 
 
 		 380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  29.67 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  29.17 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  33.83 
 
 		 380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  31.13 
 
 		 387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  34.12 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  32.01 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  31.91 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.82 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  30.34 
 
 		 390 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  33.13 
 
 		 374 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  31.27 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  30.34 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  30.08 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  27.94 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  28.72 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  30.18 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  29.79 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  28.38 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  32.01 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  29.97 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  31.62 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  28.86 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  29.86 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  29.79 
 
 		 383 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  27.86 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  33.23 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  29.74 
 
 		 416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.73 
 
 		 423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.73 
 
 		 439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  30.88 
 
 		 383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  28.65 
 
 		 385 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  30.21 
 
 		 387 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  30.03 
 
 		 383 aa  119  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.98 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  29.39 
 
 		 389 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  29.68 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  29.39 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  27.84 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  29.39 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  28.39 
 
 		 382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.99 
 
 		 423 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.99 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.11 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  31.45 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.12 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.9 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  31.25 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  30.46 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  31.82 
 
 		 388 aa  116  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  27.18 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  27.99 
 
 		 374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.2 
 
 		 393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0847  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30 
 
 		 413 aa  115  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  29.82 
 
 		 385 aa  115  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  27.18 
 
 		 383 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.18 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  28.75 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  27.18 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  27.18 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  27.53 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.18 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  28.75 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  28.75 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  28.75 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  28.44 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>