More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0771 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  100 
 
 		 380 aa  773    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  44.84 
 
 		 364 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  44.29 
 
 		 364 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.9 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  44.95 
 
 		 373 aa  266  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  44.54 
 
 		 357 aa  247  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.95 
 
 		 381 aa  162  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.21 
 
 		 389 aa  149  5e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  30.39 
 
 		 390 aa  150  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.57 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.98 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  31.87 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  32.63 
 
 		 397 aa  144  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  34.23 
 
 		 368 aa  142  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.32 
 
 		 400 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5037  peptidase M20  37.06 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.357422  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  32.31 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  32.31 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  32.62 
 
 		 406 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  32.62 
 
 		 406 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  33.42 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  32.31 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0076  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.62 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  32.31 
 
 		 406 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.43 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2796  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.77 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.884075 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  30.15 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  28.65 
 
 		 384 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  31.69 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  32.2 
 
 		 397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  29.1 
 
 		 384 aa  135  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.99 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  27.66 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  27.66 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  31.58 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  31.13 
 
 		 388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.14 
 
 		 431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  31.09 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  31.43 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  29.12 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  32.02 
 
 		 416 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  31.36 
 
 		 386 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  31.7 
 
 		 386 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  31.29 
 
 		 416 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  30.77 
 
 		 404 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  33.71 
 
 		 388 aa  132  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  31.03 
 
 		 388 aa  132  9e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  30.67 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  31.36 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  31.45 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  30.83 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.31 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  30 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.32 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.93 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.3 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  30.15 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  30.15 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  30.15 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  30.6 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  30.46 
 
 		 586 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  30.15 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  30.15 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.44 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  30.15 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  33.06 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2538  peptidase M20  29.84 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.77 
 
 		 407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.77 
 
 		 407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  30.72 
 
 		 411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  29.76 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  29.57 
 
 		 404 aa  127  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  29.68 
 
 		 387 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  30 
 
 		 403 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  33.81 
 
 		 389 aa  126  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  30.29 
 
 		 399 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2318  peptidase M20  33.53 
 
 		 449 aa  126  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00838569  decreased coverage  0.00000161577 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  30.41 
 
 		 389 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  31.3 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.57 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  30.46 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.46 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  30.46 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  30.46 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  30.46 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  33.71 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  30.46 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  30.46 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  29.92 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.38 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  30.46 
 
 		 383 aa  123  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  33.71 
 
 		 382 aa  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  29.91 
 
 		 398 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.43 
 
 		 435 aa  123  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  31.37 
 
 		 434 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  30.53 
 
 		 385 aa  123  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.05 
 
 		 410 aa  122  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  29.95 
 
 		 387 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  30.46 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  30.11 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>