More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2538 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2538  peptidase M20  100 
 
 
369 aa  749    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561977  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2727  acetylornithine deacetylase  35.51 
 
 
362 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  32.89 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  32.46 
 
 
428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  33.66 
 
 
404 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00350  acetylornithine deacetylase  33.88 
 
 
366 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0652335  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  32.89 
 
 
386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  33.12 
 
 
411 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.61 
 
 
400 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.88 
 
 
400 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0316  acetylornithine deacetylase  33.02 
 
 
364 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.692174  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0286  acetylornithine deacetylase  33.02 
 
 
364 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.311281  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  29.84 
 
 
380 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  31.59 
 
 
387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  32.61 
 
 
389 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  33.43 
 
 
375 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  32.12 
 
 
387 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  31.27 
 
 
390 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  33.54 
 
 
387 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  33.01 
 
 
397 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  31.15 
 
 
383 aa  123  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.74 
 
 
388 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  32.17 
 
 
388 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  31.98 
 
 
391 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.17 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.9 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  35.76 
 
 
387 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 
398 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  32.49 
 
 
406 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  32.49 
 
 
406 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  31.25 
 
 
386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  30.51 
 
 
419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.55 
 
 
388 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  32.49 
 
 
406 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.07 
 
 
402 aa  119  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  29.95 
 
 
376 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  31.44 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  32.21 
 
 
406 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  26.61 
 
 
381 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  32.09 
 
 
384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  31.07 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  29.7 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  32.72 
 
 
374 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  32.12 
 
 
388 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  32.9 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  32.05 
 
 
374 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  32.08 
 
 
406 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  31.2 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  30.77 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  31.83 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  31.28 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5029  acetylornithine deacetylase  31.96 
 
 
373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  31.83 
 
 
406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  31.63 
 
 
406 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.31 
 
 
398 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  30.94 
 
 
374 aa  113  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  31.83 
 
 
397 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  32.15 
 
 
416 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  31.51 
 
 
397 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.37 
 
 
391 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  31.33 
 
 
404 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  30.25 
 
 
405 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  30.25 
 
 
405 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  30.25 
 
 
405 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  30.25 
 
 
405 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  30.25 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  27.08 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  30.25 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.46 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  29.5 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  30.13 
 
 
586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  29.28 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4277  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00886468  normal  0.333205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  28.66 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  32.11 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  28.48 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  31.04 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.49 
 
 
387 aa  110  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  29.33 
 
 
383 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  29.55 
 
 
383 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2582  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.42 
 
 
397 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  29.55 
 
 
383 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  30.05 
 
 
385 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0194  acetylornithine deacetylase  30 
 
 
382 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  30.32 
 
 
416 aa  107  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  28.2 
 
 
392 aa  106  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  29.55 
 
 
379 aa  106  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  29.09 
 
 
382 aa  106  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  30.77 
 
 
385 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  30.38 
 
 
383 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  29.58 
 
 
386 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  29.16 
 
 
385 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  30.19 
 
 
382 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  29.97 
 
 
387 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  30.45 
 
 
412 aa  103  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  28.24 
 
 
378 aa  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3291  acetylornithine deacetylase  30.89 
 
 
383 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  26.82 
 
 
382 aa  102  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  28.81 
 
 
383 aa  102  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.76 
 
 
393 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>